More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3237 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  99.65 
 
 
288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  99.31 
 
 
288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  99.65 
 
 
288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  99.65 
 
 
288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  99.65 
 
 
288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  99.31 
 
 
288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  99.65 
 
 
298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  100 
 
 
271 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  99.25 
 
 
268 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  84.03 
 
 
288 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  88.41 
 
 
207 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  96.2 
 
 
194 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.86 
 
 
286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.86 
 
 
286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.86 
 
 
286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.86 
 
 
286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.86 
 
 
286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  55.52 
 
 
283 aa  316  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  57.93 
 
 
271 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  57.93 
 
 
271 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  57.93 
 
 
271 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  57.93 
 
 
271 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  58.58 
 
 
271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  58.21 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  70.05 
 
 
200 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  44 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  44 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  44 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  44 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  44 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  43.91 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  43.91 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  46.15 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  46.15 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  46.15 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  46.15 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  46.15 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  44.64 
 
 
285 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.54 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  42.56 
 
 
296 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  42.56 
 
 
296 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  43.69 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  45.07 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  43.82 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  43.73 
 
 
281 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  44.03 
 
 
296 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  41.55 
 
 
289 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  44.37 
 
 
286 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  43.71 
 
 
291 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  43.71 
 
 
291 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  43.71 
 
 
291 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  41.55 
 
 
289 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  40.91 
 
 
289 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  45.76 
 
 
278 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  39.3 
 
 
294 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  39.3 
 
 
294 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  39.3 
 
 
294 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  39.3 
 
 
294 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  39.3 
 
 
294 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.11 
 
 
291 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  79.56 
 
 
175 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  43.55 
 
 
295 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  43.21 
 
 
295 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  43.21 
 
 
295 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  43.21 
 
 
295 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  43.21 
 
 
295 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  43.21 
 
 
295 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  41.05 
 
 
293 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  41.05 
 
 
293 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  41.05 
 
 
293 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  42.76 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  42.96 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  42.96 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>