More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3716 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  100 
 
 		 288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  100 
 
 		 288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  100 
 
 		 288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  100 
 
 		 288 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  99.65 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  99.65 
 
 		 288 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  98.96 
 
 		 288 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  99.63 
 
 		 271 aa  567  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  99.63 
 
 		 268 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  84.38 
 
 		 288 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  82.29 
 
 		 288 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  88.89 
 
 		 207 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  96.74 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  64.31 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  64.31 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  64.31 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  64.31 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  64.31 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  55.87 
 
 		 283 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  57.56 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  57.56 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  57.56 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  57.56 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  59.02 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  58.65 
 
 		 271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  70.77 
 
 		 200 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  44.36 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  44.36 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  44.36 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  44.36 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  44.36 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  44.28 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  44.28 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  43.01 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  42.56 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  42.56 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  44.29 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  45.1 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  43.4 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  43.73 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  43.82 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  43.45 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  41.55 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  40.91 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  44.37 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  41.55 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  46.1 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.11 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  79.56 
 
 		 175 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  43.9 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  43.55 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  43.55 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  43.55 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  43.55 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  43.55 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  41.05 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  41.05 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  43.4 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  43.4 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  41.05 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  43.4 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  42.61 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>