More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1397 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  100 
 
 		 279 aa  583  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  100 
 
 		 279 aa  583  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  47.78 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  47.78 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  47.04 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  47.04 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  47.04 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  47.04 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  47.04 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  47.96 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 281 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  48.7 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  46.49 
 
 		 289 aa  250  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 		 289 aa  248  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  45.93 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  45.93 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  45.93 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  45.93 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  45.93 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  44.98 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  45.56 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  45.56 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.87 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.87 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.87 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.87 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  43.87 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  43.87 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  43.87 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  45.35 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.87 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  45.19 
 
 		 286 aa  234  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  42.29 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  42.29 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  45.05 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  45.05 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  43.12 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  43.12 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  43.12 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  43.12 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  43.87 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  42.29 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  42.29 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  43.12 
 
 		 294 aa  231  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  43.01 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  43.01 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  43.23 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  42.54 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  44.91 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  45.11 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  43.82 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  45.49 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  45.49 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  44.61 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  44.61 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  44.61 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  43.87 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  43.87 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  43.87 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  43.87 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  40.98 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  43.87 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  49.59 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  43.87 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  42.28 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.88 
 
 		 379 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  40.88 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>