More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0571 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  76.22 
 
 
302 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  71.43 
 
 
297 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  67.94 
 
 
296 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  70.21 
 
 
289 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  70.21 
 
 
289 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  70.21 
 
 
289 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  67.59 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  64.46 
 
 
296 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  64.46 
 
 
296 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  64.46 
 
 
296 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  64.46 
 
 
296 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  64.46 
 
 
296 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  64.46 
 
 
296 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  64.46 
 
 
296 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  58.1 
 
 
282 aa  338  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  58.1 
 
 
282 aa  338  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  58.1 
 
 
282 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  58.1 
 
 
282 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  57.75 
 
 
282 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  70.8 
 
 
231 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  54.55 
 
 
296 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0105  integrase catalytic subunit  58.46 
 
 
273 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3810  integrase catalytic subunit  58.46 
 
 
273 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000660644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  54.55 
 
 
296 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  54.06 
 
 
296 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  54.06 
 
 
296 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  54.06 
 
 
296 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  54.06 
 
 
296 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  55.87 
 
 
283 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2445  putative IS3 type transposase integrase (orfB)  66.49 
 
 
226 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00380003  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  49.82 
 
 
281 aa  271  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  46.1 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  46.1 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  46.1 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  46.1 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  45.74 
 
 
294 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  50.54 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  50.54 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  50.54 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  50.54 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  50.54 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  48.2 
 
 
277 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  46.21 
 
 
270 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  46.21 
 
 
270 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  45.85 
 
 
270 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  45.85 
 
 
270 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  45.85 
 
 
270 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  45.85 
 
 
270 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  45.85 
 
 
270 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  47.33 
 
 
286 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  47.33 
 
 
286 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  47.33 
 
 
286 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  47.33 
 
 
286 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  46.62 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  46.98 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  46.62 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  47.52 
 
 
275 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  47.52 
 
 
275 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  47.52 
 
 
275 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  48.75 
 
 
286 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 
271 aa  245  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  46.32 
 
 
271 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  47.2 
 
 
289 aa  242  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.84 
 
 
288 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  45.04 
 
 
298 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  45.04 
 
 
298 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  45.04 
 
 
298 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  46.79 
 
 
285 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  41.05 
 
 
379 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.62 
 
 
286 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.73 
 
 
286 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.73 
 
 
286 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>