More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1569 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  70.88 
 
 
285 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  56.94 
 
 
302 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  56.94 
 
 
293 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  56.94 
 
 
302 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  56.94 
 
 
293 aa  346  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  56.03 
 
 
291 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  48.5 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  48.5 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  48.5 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  48.5 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  48.5 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  48.5 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  48.5 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  45.69 
 
 
281 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  47 
 
 
286 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  47 
 
 
286 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  47 
 
 
286 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  47 
 
 
286 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  47 
 
 
286 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  45.91 
 
 
296 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  45.91 
 
 
296 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  45.91 
 
 
296 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  45.91 
 
 
296 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.91 
 
 
288 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  46.62 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  46.62 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  44.41 
 
 
286 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  44.41 
 
 
286 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  44.41 
 
 
286 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  44.41 
 
 
286 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  44.06 
 
 
286 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  43.36 
 
 
286 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  43.36 
 
 
286 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  45.9 
 
 
271 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
280 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  44.19 
 
 
277 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  44.78 
 
 
271 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  43.51 
 
 
286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  43.51 
 
 
286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  43.51 
 
 
286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  43.51 
 
 
286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  43.51 
 
 
286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  45.14 
 
 
297 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  44.87 
 
 
274 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  43.6 
 
 
296 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  44.87 
 
 
286 aa  235  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  41.96 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  41.96 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  41.96 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  41.96 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  41.96 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  43.82 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  43.82 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  41.96 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  43.25 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  43.07 
 
 
272 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  45.96 
 
 
271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  45.96 
 
 
271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  45.96 
 
 
271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  43.98 
 
 
279 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  45.96 
 
 
271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
291 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  43.97 
 
 
296 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  41.4 
 
 
286 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  46.15 
 
 
283 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  41.49 
 
 
379 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  43.1 
 
 
288 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  45.22 
 
 
291 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  45.22 
 
 
291 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  45.22 
 
 
291 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  45.22 
 
 
291 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  45.22 
 
 
291 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>