More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1072 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  100 
 
 
302 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  99.34 
 
 
302 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  100 
 
 
293 aa  617  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  99.32 
 
 
293 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  64.41 
 
 
291 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  57.65 
 
 
285 aa  338  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  56.94 
 
 
285 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  52.99 
 
 
270 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  52.99 
 
 
270 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  52.79 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  52.79 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  52.79 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  52.79 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  52.79 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.69 
 
 
296 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.69 
 
 
296 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 
296 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 
296 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 
296 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 
296 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  46.3 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  46.45 
 
 
286 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  47.6 
 
 
280 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  47.6 
 
 
280 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  47.6 
 
 
280 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  45.74 
 
 
286 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  45.74 
 
 
286 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  48.51 
 
 
274 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  47.48 
 
 
286 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  46.82 
 
 
277 aa  251  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  46.13 
 
 
379 aa  247  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.36 
 
 
286 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.36 
 
 
286 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.36 
 
 
286 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.36 
 
 
286 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  46.13 
 
 
294 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.49 
 
 
286 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  43.86 
 
 
296 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  44.21 
 
 
296 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  44.21 
 
 
296 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  44.21 
 
 
296 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  44.21 
 
 
296 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  44.21 
 
 
296 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  44.21 
 
 
296 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  44.21 
 
 
296 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  44.33 
 
 
295 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  44.33 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  44.33 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  44.33 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  44.33 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  44.33 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  45.04 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  45.04 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  45.04 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  45.04 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  45.04 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.35 
 
 
288 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  45.2 
 
 
291 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  43.71 
 
 
297 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  43.77 
 
 
286 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  47.76 
 
 
272 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  43.16 
 
 
296 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  47.76 
 
 
272 aa  241  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  47.76 
 
 
272 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  47.76 
 
 
272 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  45.23 
 
 
289 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  44.49 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  44.49 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  44.49 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  47.39 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  47.39 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  47.39 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  47.39 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  47.01 
 
 
272 aa  238  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  47.39 
 
 
272 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  45.39 
 
 
289 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  45.39 
 
 
289 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>