More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2281 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  99.32 
 
 
295 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  69.46 
 
 
298 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  69.46 
 
 
298 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  69.46 
 
 
298 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  57.29 
 
 
293 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  57.29 
 
 
293 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  57.64 
 
 
293 aa  338  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  57.64 
 
 
293 aa  338  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  57.64 
 
 
293 aa  338  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  48.95 
 
 
294 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  48.95 
 
 
294 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  48.95 
 
 
294 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  48.95 
 
 
294 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  48.95 
 
 
294 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  50.34 
 
 
286 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  50.69 
 
 
286 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  50.34 
 
 
286 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  50.34 
 
 
286 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  47.94 
 
 
270 aa  258  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  48.9 
 
 
277 aa  258  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  47.94 
 
 
270 aa  258  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  49.43 
 
 
275 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  50.72 
 
 
291 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  49.43 
 
 
275 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  49.43 
 
 
275 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  49.65 
 
 
288 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  47.19 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  47.19 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  47.19 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  47.19 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  47.19 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  45.95 
 
 
297 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  49.3 
 
 
296 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  49.3 
 
 
296 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  49.3 
 
 
296 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  49.3 
 
 
296 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  46.55 
 
 
296 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  46.55 
 
 
296 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  46.55 
 
 
296 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  46.55 
 
 
296 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  46.55 
 
 
296 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  46.55 
 
 
296 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  46.55 
 
 
296 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  48.42 
 
 
289 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  47.92 
 
 
276 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  44.33 
 
 
302 aa  244  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  44.33 
 
 
302 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  44.33 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  44.33 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  47.39 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  48.6 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  48.6 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  48.52 
 
 
281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  48.6 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  48.6 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  48.6 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.57 
 
 
296 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.57 
 
 
296 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  48.41 
 
 
289 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  48.41 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  44.85 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  45.73 
 
 
296 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  47.99 
 
 
378 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  47.99 
 
 
378 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.1 
 
 
286 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.1 
 
 
286 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.1 
 
 
286 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.1 
 
 
286 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.1 
 
 
286 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  47.99 
 
 
378 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  47.99 
 
 
378 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  45.1 
 
 
285 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  44.93 
 
 
302 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>