More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1989 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  100 
 
 
289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  99.65 
 
 
289 aa  598  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  95.85 
 
 
289 aa  557  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1980  integrase catalytic subunit  99.12 
 
 
269 aa  468  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340546  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0652  integrase catalytic subunit  99.12 
 
 
260 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1991  integrase catalytic subunit  99.12 
 
 
260 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2230  integrase catalytic subunit  82.23 
 
 
198 aa  341  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.226944  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  51.76 
 
 
294 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  51.76 
 
 
294 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  51.76 
 
 
294 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  51.76 
 
 
294 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  51.76 
 
 
294 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  52.13 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  52.13 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  52.13 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  52.13 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  52.13 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  49.65 
 
 
286 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  51.61 
 
 
281 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  52.82 
 
 
291 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  50.19 
 
 
270 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  50.19 
 
 
270 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  49.81 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  49.81 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  49.81 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  49.81 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  49.81 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  51.85 
 
 
277 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  48.23 
 
 
286 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  48.23 
 
 
286 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  48.23 
 
 
286 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.74 
 
 
286 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.74 
 
 
286 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.74 
 
 
286 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.74 
 
 
286 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.74 
 
 
286 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  48.23 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  47.87 
 
 
286 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  49.26 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  47.52 
 
 
286 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  47.52 
 
 
286 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  47.42 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  47.42 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  47.42 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  47.42 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  48.44 
 
 
296 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  48.1 
 
 
296 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.42 
 
 
296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.42 
 
 
296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  47.94 
 
 
286 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  46.29 
 
 
289 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  46.29 
 
 
289 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  46.29 
 
 
289 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.1 
 
 
379 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  48.28 
 
 
297 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  48.47 
 
 
274 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  44.1 
 
 
294 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
271 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
271 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
271 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
271 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  48.51 
 
 
275 aa  262  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  48.51 
 
 
275 aa  262  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  48.51 
 
 
275 aa  262  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  48.91 
 
 
283 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  49.26 
 
 
279 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  49.26 
 
 
279 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  47.16 
 
 
291 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  49.81 
 
 
279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  44.91 
 
 
291 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  44.91 
 
 
291 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  46.35 
 
 
280 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  46.35 
 
 
280 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  46.35 
 
 
280 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>