More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0907 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  83.85 
 
 
289 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  83.85 
 
 
289 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  83.85 
 
 
289 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  68.17 
 
 
302 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  69.76 
 
 
291 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  63.45 
 
 
297 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  62.5 
 
 
296 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  79.65 
 
 
231 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  61.59 
 
 
296 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  61.59 
 
 
296 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  61.59 
 
 
296 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  61.59 
 
 
296 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  61.59 
 
 
296 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  61.59 
 
 
296 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  61.59 
 
 
296 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  61.67 
 
 
296 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  57.69 
 
 
282 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  57.69 
 
 
282 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  57.69 
 
 
282 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  57.34 
 
 
282 aa  331  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  57.34 
 
 
282 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  56.29 
 
 
296 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  56.29 
 
 
296 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  55.94 
 
 
296 aa  324  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  55.94 
 
 
296 aa  324  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  55.94 
 
 
296 aa  324  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  55.94 
 
 
296 aa  324  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  55.04 
 
 
281 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0105  integrase catalytic subunit  53.26 
 
 
273 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3810  integrase catalytic subunit  53.26 
 
 
273 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000660644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  56.92 
 
 
283 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  45.96 
 
 
270 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  45.96 
 
 
270 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  45.96 
 
 
270 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  45.96 
 
 
270 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  45.96 
 
 
270 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  45.96 
 
 
270 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  45.96 
 
 
270 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  44.83 
 
 
294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  44.83 
 
 
294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  44.83 
 
 
294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  44.83 
 
 
294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  47.67 
 
 
286 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  48.03 
 
 
286 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  48.03 
 
 
286 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  47.67 
 
 
286 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  47.67 
 
 
286 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  47.67 
 
 
286 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  44.48 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  46.57 
 
 
275 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  47.31 
 
 
286 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  47.79 
 
 
277 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.11 
 
 
379 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  42.11 
 
 
294 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  43.66 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  45 
 
 
286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  45 
 
 
286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  45 
 
 
286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  45 
 
 
286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  45 
 
 
286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  45.16 
 
 
288 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  43.12 
 
 
272 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  44.2 
 
 
274 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  43.12 
 
 
272 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  43.12 
 
 
272 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  43.12 
 
 
272 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3767  putative transposase  59.43 
 
 
263 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  42.75 
 
 
272 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  44.81 
 
 
280 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  45.96 
 
 
289 aa  245  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  42.39 
 
 
272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  42.39 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  42.39 
 
 
272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>