More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2892 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  100 
 
 		 274 aa  578  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  70.52 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  70.52 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  70.52 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  70.52 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  70.52 
 
 		 294 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  70.15 
 
 		 272 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  69.78 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  69.4 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  69.03 
 
 		 272 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  68.66 
 
 		 272 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  68.16 
 
 		 272 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  61.68 
 
 		 275 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  51.85 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  60.08 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  51.33 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  51.33 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  51.33 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  51.33 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  51.33 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  51.33 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  51.33 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  54.62 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  51.15 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  51.15 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  51.54 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0599  IS30 family transposase  53.6 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  50.38 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  49.08 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  49.08 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  49.08 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  49.08 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  48.85 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  48.85 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  48.85 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  49.06 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.45 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.45 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  51.34 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  51.34 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  51.34 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  51.34 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  51.34 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  50.96 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.67 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.67 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.67 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.67 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.67 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  47.94 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  48.88 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  48.88 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  47.04 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  49.62 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  44.16 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  44.16 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  44.16 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  56.1 
 
 		 208 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  44.93 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  45.13 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>