More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1089 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  100 
 
 
286 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  89.47 
 
 
286 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  89.47 
 
 
286 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  89.47 
 
 
286 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  89.47 
 
 
286 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  89.47 
 
 
286 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  69.72 
 
 
287 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  62.94 
 
 
286 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  62.94 
 
 
286 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  62.94 
 
 
286 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  62.24 
 
 
286 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  62.24 
 
 
286 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  62.59 
 
 
286 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  50 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  50 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  49.65 
 
 
289 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  50.75 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  50.75 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  50.75 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  50.75 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  50.75 
 
 
270 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  49.29 
 
 
289 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  51.06 
 
 
296 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  51.06 
 
 
296 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  51.06 
 
 
296 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  51.06 
 
 
296 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  48.87 
 
 
277 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.94 
 
 
286 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.94 
 
 
286 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.94 
 
 
286 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.94 
 
 
286 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.94 
 
 
286 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  48.96 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  48.96 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  48.96 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  48.96 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  48.96 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  48.96 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  48.96 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  47.08 
 
 
302 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  49.3 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  49.3 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  48.55 
 
 
281 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  50.38 
 
 
286 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  50.96 
 
 
274 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  47 
 
 
291 aa  258  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  46.53 
 
 
296 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  45.49 
 
 
296 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  49.06 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  47.7 
 
 
288 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  45.89 
 
 
297 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  49.06 
 
 
271 aa  248  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  42.25 
 
 
294 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  42.25 
 
 
294 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  42.25 
 
 
294 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  42.25 
 
 
294 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  42.25 
 
 
294 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  48.75 
 
 
291 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  48.75 
 
 
291 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  48.75 
 
 
291 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  48.75 
 
 
291 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  48.75 
 
 
291 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  48.75 
 
 
291 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  48.75 
 
 
291 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  46.01 
 
 
289 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  46.01 
 
 
289 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  46.01 
 
 
289 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  50.42 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  46.04 
 
 
291 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  46.04 
 
 
291 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  47.18 
 
 
291 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  43.88 
 
 
280 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  46.01 
 
 
379 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  43.94 
 
 
274 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  46.01 
 
 
294 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  46.95 
 
 
275 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  43.66 
 
 
288 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>