More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1288 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  97.05 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.1 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.1 
 
 		 286 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.1 
 
 		 286 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.1 
 
 		 286 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  63.1 
 
 		 286 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  56.39 
 
 		 283 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  54.48 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  54.48 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  54.48 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  54.48 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  59.02 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  59.02 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  59.02 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  58.58 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  59.02 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  58.58 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  59.02 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  59.02 
 
 		 288 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  58.21 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0614  IS3 ORF2  98.65 
 
 		 199 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  57.52 
 
 		 288 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1292  IS3 ORF2  97.96 
 
 		 168 aa  299  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.276871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  58.17 
 
 		 268 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  54.89 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  68.69 
 
 		 200 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  45.49 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  45.49 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  45.86 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  50.19 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  50.19 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  50.19 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  50.19 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  50.19 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 281 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  61.69 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  49.06 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  45.86 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  43.75 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  43.75 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  44.44 
 
 		 289 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  44.44 
 
 		 289 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  44.44 
 
 		 289 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  45.69 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  45.69 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  45.56 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  46.07 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  45.19 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  40.67 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  47.23 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  45.93 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  45.93 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  45.93 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  45.93 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  45.93 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  45.93 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  45.93 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  47.23 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  46.86 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  40.67 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  40.67 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  40.67 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  40.67 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  46.86 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  46.86 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>