More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2361 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 167 aa  352  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  90.96 
 
 		 279 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  89.76 
 
 		 279 aa  317  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  88.55 
 
 		 279 aa  307  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  74.07 
 
 		 270 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  71.17 
 
 		 271 aa  259  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  72.22 
 
 		 180 aa  258  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  71.17 
 
 		 270 aa  257  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  72.22 
 
 		 269 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  68.1 
 
 		 293 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  68.1 
 
 		 293 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  68.1 
 
 		 293 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  68.52 
 
 		 277 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  68.79 
 
 		 231 aa  245  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  67.28 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  65.03 
 
 		 255 aa  244  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  65.03 
 
 		 255 aa  244  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  66.87 
 
 		 291 aa  243  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  66.87 
 
 		 291 aa  243  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  66.87 
 
 		 291 aa  243  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  66.05 
 
 		 274 aa  243  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  67.95 
 
 		 291 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  67.95 
 
 		 291 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  67.95 
 
 		 291 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  68.59 
 
 		 283 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  68.59 
 
 		 283 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  68.59 
 
 		 283 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  68.59 
 
 		 283 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  68.59 
 
 		 283 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  68.59 
 
 		 283 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  62.96 
 
 		 383 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  65.81 
 
 		 283 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  65.81 
 
 		 283 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  66.03 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  62.18 
 
 		 272 aa  221  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  62.18 
 
 		 166 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  62.34 
 
 		 269 aa  213  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  62.75 
 
 		 267 aa  213  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  62.75 
 
 		 267 aa  213  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  67.1 
 
 		 269 aa  208  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  62.33 
 
 		 259 aa  208  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  60.9 
 
 		 272 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  59.21 
 
 		 239 aa  187  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  56.49 
 
 		 286 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  54.14 
 
 		 294 aa  184  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  54.14 
 
 		 294 aa  184  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  54.14 
 
 		 294 aa  184  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  54.14 
 
 		 294 aa  184  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  54.14 
 
 		 294 aa  184  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  55.35 
 
 		 293 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  55.19 
 
 		 207 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  55.56 
 
 		 275 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  55.56 
 
 		 275 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  55.35 
 
 		 293 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  55.35 
 
 		 293 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  55.56 
 
 		 275 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  55.35 
 
 		 293 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  55.35 
 
 		 293 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  53.9 
 
 		 286 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 280 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 280 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  69.23 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  54.84 
 
 		 291 aa  175  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  54.84 
 
 		 277 aa  175  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  50.65 
 
 		 280 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  50.65 
 
 		 280 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  50.65 
 
 		 280 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  50.98 
 
 		 272 aa  171  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  53.25 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  51.95 
 
 		 288 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  51.97 
 
 		 286 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  51.97 
 
 		 286 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  51.97 
 
 		 286 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  51.97 
 
 		 286 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  51.97 
 
 		 286 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  51.97 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  52.6 
 
 		 288 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  52.6 
 
 		 268 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  52.6 
 
 		 288 aa  168  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  52.6 
 
 		 298 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  52.6 
 
 		 288 aa  168  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  52.6 
 
 		 288 aa  168  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  52.6 
 
 		 288 aa  168  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  52.63 
 
 		 288 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  52.63 
 
 		 288 aa  167  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  52.63 
 
 		 288 aa  167  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  52.63 
 
 		 288 aa  167  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  52.63 
 
 		 288 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  52.63 
 
 		 288 aa  167  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>