More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4425 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  99.48 
 
 
283 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  96.34 
 
 
250 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  88.48 
 
 
283 aa  352  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  88.48 
 
 
283 aa  352  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  61.45 
 
 
272 aa  239  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  60.89 
 
 
272 aa  238  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  57.29 
 
 
290 aa  235  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  61.11 
 
 
293 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  61.11 
 
 
293 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  61.11 
 
 
293 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  61.11 
 
 
277 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  55.73 
 
 
252 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  55.56 
 
 
291 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  55.56 
 
 
291 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  55.56 
 
 
291 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  59.89 
 
 
271 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  58.33 
 
 
279 aa  214  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  56.91 
 
 
279 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  56.67 
 
 
279 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  58.89 
 
 
274 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  56.82 
 
 
259 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  57.63 
 
 
270 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  55.93 
 
 
270 aa  198  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  51.35 
 
 
291 aa  197  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  51.35 
 
 
291 aa  197  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  51.35 
 
 
291 aa  197  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
383 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  51.05 
 
 
283 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  51.05 
 
 
283 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  51.05 
 
 
283 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  51.05 
 
 
283 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  51.05 
 
 
283 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  51.05 
 
 
283 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  52.22 
 
 
269 aa  193  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  55.37 
 
 
269 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  51.67 
 
 
269 aa  193  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  51.96 
 
 
267 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  51.96 
 
 
267 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.7 
 
 
255 aa  188  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.7 
 
 
255 aa  188  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  60.58 
 
 
231 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3398  integrase catalytic region  49.72 
 
 
199 aa  180  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  56.29 
 
 
239 aa  170  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  46.39 
 
 
281 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.71 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.71 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.71 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.71 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.71 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  45.41 
 
 
286 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5539  transposase  41.62 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.0199842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  45.41 
 
 
286 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  43.46 
 
 
280 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  43.46 
 
 
280 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00574  transposase and inactivated derivatives  44.44 
 
 
223 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02274  transposase and inactivated derivatives  44.97 
 
 
223 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.02 
 
 
288 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  41.18 
 
 
270 aa  150  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  41.18 
 
 
270 aa  150  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  45.21 
 
 
296 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  45.21 
 
 
296 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  45.21 
 
 
296 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  45.21 
 
 
296 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  41.76 
 
 
270 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
232 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  41.76 
 
 
270 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  41.76 
 
 
270 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  41.76 
 
 
270 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  41.76 
 
 
270 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  44.39 
 
 
296 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  44.39 
 
 
296 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  45.79 
 
 
295 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  45.79 
 
 
295 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  45.79 
 
 
295 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  45.79 
 
 
295 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  45.79 
 
 
295 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  44.15 
 
 
283 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  45.79 
 
 
295 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  44.92 
 
 
298 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  44.92 
 
 
298 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  44.92 
 
 
298 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  41.58 
 
 
379 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  41.58 
 
 
294 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1456  integrase catalytic region  40.78 
 
 
237 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0392097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3767  putative transposase  43.98 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  43.41 
 
 
272 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  43.41 
 
 
272 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  43.41 
 
 
272 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>