182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01885 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  77.92 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  53.69 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  53.69 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  46.09 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  42.92 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  44.17 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  38.43 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  38.03 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  38.93 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  37.17 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  38.46 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  38.27 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  36.4 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  39.22 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  35.89 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  38.2 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  33.74 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  39.32 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  34.29 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  39.41 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  41.43 
 
 		 259 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  36.54 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  37.75 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  36.67 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  34.57 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  34.85 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  34.43 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  39.62 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  39.62 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  38.24 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  32.24 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  32.69 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  35.58 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  28.16 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  37.09 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  35.1 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  35.1 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  35.1 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  26.47 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  34.83 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  31.84 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  32.76 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  32.57 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  30.45 
 
 		 233 aa  99  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  31.25 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  28.08 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.27 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  36.24 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  33.49 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  33.49 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  33.55 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  33.55 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  31.11 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  29.82 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  32.89 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  32.89 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  32.89 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.01 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  31.8 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  32.89 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.49 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  32.24 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  31.58 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  26.05 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  28.4 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  30.33 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  32.82 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  28.99 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  27.27 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  32.27 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  30.26 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  29.52 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  27.08 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  27.08 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  27.08 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  27.23 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  31.84 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  27.31 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  27.01 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  27.08 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  27.27 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  28.5 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  26.14 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  26.14 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  26.14 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  28.81 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  28.81 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  30.61 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  26.56 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  26.14 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  27.16 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  27.1 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  30.86 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  29.52 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  26.64 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>