More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2964 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2964  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1021    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.07748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2749  methionyl-tRNA synthetase  87.25 
 
 		 499 aa  901    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0342203  normal  0.0114918 
 
 
-
 
NC_003296  RS03104  methionyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3666  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 486 aa  302  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 553 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 553 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 553 aa  181  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 699 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  31.82 
 
 		 645 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 734 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  30.07 
 
 		 662 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  26.74 
 
 		 749 aa  163  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  31.42 
 
 		 659 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  29.2 
 
 		 671 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 662 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 577 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 565 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3624  Methionine--tRNA ligase  31.56 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 663 aa  156  8e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 		 663 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 600 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 		 703 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 663 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 663 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 606 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 605 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 570 aa  147  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 570 aa  147  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 605 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 688 aa  146  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 599 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 595 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 672 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 592 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 690 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 603 aa  144  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 611 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 600 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 600 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 711 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 597 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 592 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 669 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 544 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  27.39 
 
 		 593 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 678 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 663 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2662  Methionine--tRNA ligase  29.18 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 600 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 705 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0963  methionyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 551 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000994373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 544 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  25.6 
 
 		 557 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 680 aa  136  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 664 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 544 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 662 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 565 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 567 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 702 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 693 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 		 596 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 700 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  24.16 
 
 		 625 aa  133  9e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 550 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 717 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 		 702 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 691 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 704 aa  130  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  22.93 
 
 		 702 aa  130  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 697 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 614 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 680 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 617 aa  127  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 705 aa  126  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 568 aa  123  8e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 684 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 681 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2846  methionyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 710 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0283  methionyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 573 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>