More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0877 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0877  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 570 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0214075  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  65.79 
 
 		 577 aa  699    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  90.7 
 
 		 570 aa  844    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  54.7 
 
 		 573 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.39 
 
 		 575 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  53.4 
 
 		 576 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  54.88 
 
 		 575 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  54.88 
 
 		 575 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  55.49 
 
 		 574 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  55.49 
 
 		 574 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  55.54 
 
 		 574 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.36 
 
 		 612 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 606 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  37.97 
 
 		 611 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  35 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  35.6 
 
 		 598 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  32.73 
 
 		 597 aa  253  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  33.98 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 619 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  38.72 
 
 		 596 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  35.47 
 
 		 603 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  34.43 
 
 		 597 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.17 
 
 		 605 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  27.95 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  28.96 
 
 		 611 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.83 
 
 		 768 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  34.03 
 
 		 608 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  31.29 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  32.08 
 
 		 784 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  44.83 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  30.68 
 
 		 585 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  27.5 
 
 		 590 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  29.26 
 
 		 582 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 600 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  32.2 
 
 		 739 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  26.13 
 
 		 566 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  30.82 
 
 		 768 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  26 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  30.82 
 
 		 814 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.93 
 
 		 579 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  30.12 
 
 		 586 aa  209  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  31.16 
 
 		 784 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  30.46 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  31.31 
 
 		 600 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.41 
 
 		 593 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.96 
 
 		 613 aa  209  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  28.42 
 
 		 572 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  29.37 
 
 		 588 aa  208  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  30.56 
 
 		 660 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  24.91 
 
 		 585 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  30.51 
 
 		 596 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  32.12 
 
 		 594 aa  208  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  28.76 
 
 		 658 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  30.26 
 
 		 598 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.54 
 
 		 612 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  26.92 
 
 		 582 aa  206  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.8 
 
 		 741 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  30.26 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  30.26 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  30.09 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  30.37 
 
 		 612 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  28.55 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  31.78 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.12 
 
 		 597 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.58 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 		 596 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.9 
 
 		 593 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.58 
 
 		 637 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.75 
 
 		 591 aa  204  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  25.98 
 
 		 636 aa  204  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  33.4 
 
 		 581 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  32.46 
 
 		 611 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.88 
 
 		 637 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 597 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.91 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  25.86 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.9 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  24.74 
 
 		 599 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  28.06 
 
 		 607 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  30.48 
 
 		 602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  30.19 
 
 		 594 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  29.9 
 
 		 596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.67 
 
 		 572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  28.76 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  29.28 
 
 		 1194 aa  202  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  29.53 
 
 		 579 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  31.86 
 
 		 778 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  31.46 
 
 		 603 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.94 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  25.19 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  31.41 
 
 		 603 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  30.15 
 
 		 644 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  30.02 
 
 		 598 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  28.76 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  33.22 
 
 		 600 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>