More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2146 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  91.74 
 
 		 1108 aa  1248    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  63.39 
 
 		 876 aa  825    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  64.66 
 
 		 872 aa  813    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  100 
 
 		 666 aa  1344    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  64.76 
 
 		 918 aa  896    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  64.61 
 
 		 773 aa  851    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  99.25 
 
 		 1105 aa  1336    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  96.1 
 
 		 1105 aa  1269    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  64.46 
 
 		 914 aa  894    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  54.3 
 
 		 1091 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  64.1 
 
 		 896 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  54.98 
 
 		 1126 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  64.46 
 
 		 663 aa  848    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  51.39 
 
 		 1155 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  52.29 
 
 		 1104 aa  628  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  51.76 
 
 		 1150 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  52.71 
 
 		 1113 aa  628  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  52.71 
 
 		 1113 aa  628  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  52.92 
 
 		 1086 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  51.94 
 
 		 1100 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  51.36 
 
 		 1120 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  49.17 
 
 		 1086 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  47.78 
 
 		 1088 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  50.15 
 
 		 1209 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  47.63 
 
 		 1178 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  47.47 
 
 		 1088 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  46.05 
 
 		 1134 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  47.12 
 
 		 1070 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  48.56 
 
 		 777 aa  552  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  46.4 
 
 		 1073 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  46.75 
 
 		 1082 aa  545  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  46.6 
 
 		 1082 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  46.67 
 
 		 1082 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 		 1073 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  45.34 
 
 		 1073 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  47.35 
 
 		 1080 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 		 1073 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.34 
 
 		 1073 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  46.08 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  43.02 
 
 		 1090 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  44.26 
 
 		 991 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  46.05 
 
 		 1088 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  43.83 
 
 		 1110 aa  512  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  42.18 
 
 		 1161 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  41.82 
 
 		 1068 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.57 
 
 		 1069 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  47.69 
 
 		 1068 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.03 
 
 		 1091 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  47.14 
 
 		 1071 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.51 
 
 		 1068 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 		 1139 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  43.47 
 
 		 1087 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  47.56 
 
 		 1055 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  44.29 
 
 		 1077 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.51 
 
 		 1082 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.95 
 
 		 1403 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  45.04 
 
 		 1386 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  45.45 
 
 		 1362 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40 
 
 		 1062 aa  399  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  45.23 
 
 		 1068 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  43.51 
 
 		 1031 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.06 
 
 		 982 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  44.61 
 
 		 1003 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  36.55 
 
 		 964 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  43.89 
 
 		 977 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  42.77 
 
 		 1084 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  42.97 
 
 		 1084 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 1112 aa  392  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  42.86 
 
 		 1125 aa  392  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 		 1261 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 		 1129 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  45.22 
 
 		 1021 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  42.17 
 
 		 1069 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  44.9 
 
 		 1357 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  47.88 
 
 		 985 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  41.77 
 
 		 1069 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  40.31 
 
 		 1354 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  44.68 
 
 		 1127 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  43.49 
 
 		 924 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 		 1066 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.46 
 
 		 1118 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  43.33 
 
 		 1130 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 		 1069 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  42.97 
 
 		 988 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  45.59 
 
 		 1112 aa  369  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  38.89 
 
 		 1181 aa  366  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  45.15 
 
 		 1110 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  42.49 
 
 		 1250 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  43.08 
 
 		 1437 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.44 
 
 		 925 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  42.19 
 
 		 1084 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.27 
 
 		 1227 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  42.28 
 
 		 1066 aa  365  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.17 
 
 		 933 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.23 
 
 		 1082 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  44.01 
 
 		 1284 aa  359  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  38.23 
 
 		 1064 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  42.8 
 
 		 918 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  42.6 
 
 		 1064 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  39.13 
 
 		 1163 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>