More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54153 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  100 
 
 		 491 aa  1028    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  57.29 
 
 		 498 aa  579  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  55.63 
 
 		 470 aa  553  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  50.4 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  46.33 
 
 		 488 aa  458  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  45.43 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  33.18 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  29.52 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  30.87 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  30.66 
 
 		 479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  31.03 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  30.26 
 
 		 500 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  30.09 
 
 		 449 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  30.16 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  28.98 
 
 		 450 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  28.31 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  30.14 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  28.98 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  27.9 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  27.9 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  29.02 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  28.25 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  27.89 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  29 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  28.24 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  25.52 
 
 		 454 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  27.7 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.2 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.34 
 
 		 427 aa  140  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  27.66 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.76 
 
 		 399 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  27.59 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  28.05 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  29.62 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  27.6 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  28.33 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  27.71 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  27.36 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  26.42 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  26.07 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  26.11 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  27.85 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  27.85 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  27.85 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  27.38 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  27.85 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  28.09 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  27.85 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  27.86 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  28.47 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  26.17 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  27.85 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  27.85 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  27.29 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  28.04 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  26.05 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  25.97 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  27.01 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  27.78 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  25.42 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  25.93 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  25.83 
 
 		 453 aa  126  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  27 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  28.51 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  25.88 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  26.65 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  25.79 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  26.24 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  25.97 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  24.77 
 
 		 392 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  26.5 
 
 		 441 aa  123  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  25.34 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  25.97 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.32 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  25.92 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  25.69 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2619  diaminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase  27.08 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  29.72 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  26 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  28.18 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  28.1 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  28 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  27.12 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  26.62 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  24.54 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  26.35 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01150  acetylornithine aminotransferase, ornithine transaminase (Eurofung)  26.27 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.202493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  25.29 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  25.93 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  27.42 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.53 
 
 		 436 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  26.15 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  27.55 
 
 		 430 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  26.59 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  26 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  26.17 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.41 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  25.66 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  25.7 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  24.64 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>