More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50326 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  48.61 
 
 		 1073 aa  924    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  49.8 
 
 		 1068 aa  928    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  100 
 
 		 998 aa  2066    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  50.31 
 
 		 1068 aa  980    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  44.27 
 
 		 1023 aa  802    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  47.9 
 
 		 933 aa  896    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  35.77 
 
 		 1175 aa  538  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  44.66 
 
 		 872 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  44.47 
 
 		 1239 aa  437  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  43.62 
 
 		 1185 aa  425  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  39.23 
 
 		 906 aa  331  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.81 
 
 		 933 aa  325  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.71 
 
 		 952 aa  324  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30.03 
 
 		 893 aa  323  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  29.25 
 
 		 918 aa  321  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  29.12 
 
 		 924 aa  317  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  38.46 
 
 		 919 aa  314  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.3 
 
 		 951 aa  314  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  28.42 
 
 		 926 aa  312  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.12 
 
 		 931 aa  312  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  36.89 
 
 		 924 aa  312  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  37.87 
 
 		 927 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.66 
 
 		 927 aa  311  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  29.21 
 
 		 904 aa  310  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.38 
 
 		 947 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  29.89 
 
 		 908 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.68 
 
 		 908 aa  310  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  28.15 
 
 		 889 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  30.31 
 
 		 908 aa  308  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.4 
 
 		 996 aa  307  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.79 
 
 		 950 aa  306  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.22 
 
 		 929 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  39.18 
 
 		 916 aa  303  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.86 
 
 		 981 aa  303  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  28.28 
 
 		 972 aa  300  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  37.35 
 
 		 924 aa  300  9e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  35.73 
 
 		 952 aa  299  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.12 
 
 		 919 aa  298  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  38.28 
 
 		 908 aa  297  7e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  38.2 
 
 		 909 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  37.12 
 
 		 890 aa  296  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  37.6 
 
 		 906 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 964 aa  296  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.01 
 
 		 762 aa  294  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  37.27 
 
 		 936 aa  294  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.69 
 
 		 984 aa  293  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  37.11 
 
 		 905 aa  292  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  34.9 
 
 		 994 aa  292  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.71 
 
 		 918 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 918 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 918 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.9 
 
 		 917 aa  287  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.11 
 
 		 921 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.12 
 
 		 815 aa  284  6.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  33.76 
 
 		 1055 aa  284  6.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.44 
 
 		 932 aa  281  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  27.07 
 
 		 953 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  33.76 
 
 		 967 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  33.94 
 
 		 863 aa  269  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  33.76 
 
 		 967 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  34.48 
 
 		 1003 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  33.39 
 
 		 877 aa  268  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  54.21 
 
 		 1293 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.94 
 
 		 709 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.73 
 
 		 843 aa  252  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.64 
 
 		 817 aa  207  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.31 
 
 		 990 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.69 
 
 		 861 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.69 
 
 		 861 aa  188  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.41 
 
 		 845 aa  188  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  48.45 
 
 		 1026 aa  185  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 950 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.34 
 
 		 950 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 		 861 aa  182  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.62 
 
 		 876 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.29 
 
 		 1231 aa  179  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  48.04 
 
 		 961 aa  178  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  28.27 
 
 		 842 aa  177  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.9 
 
 		 827 aa  177  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.45 
 
 		 951 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.63 
 
 		 861 aa  174  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.91 
 
 		 873 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.48 
 
 		 832 aa  172  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.12 
 
 		 868 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.92 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  27.27 
 
 		 885 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.13 
 
 		 710 aa  168  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.18 
 
 		 837 aa  168  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 		 870 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  26.64 
 
 		 830 aa  167  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.1 
 
 		 424 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  30.02 
 
 		 853 aa  165  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.68 
 
 		 837 aa  166  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 		 847 aa  164  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.42 
 
 		 894 aa  164  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.51 
 
 		 852 aa  162  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 852 aa  162  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 852 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.99 
 
 		 866 aa  162  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.78 
 
 		 835 aa  161  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>