More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12620 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12620  predicted protein  100 
 
 
532 aa  1090    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04190  vesicular-fusion protein sec18, putative  55.09 
 
 
844 aa  559  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30476  predicted protein  55.66 
 
 
737 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.59852  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  49.42 
 
 
794 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03098  vesicular fusion ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12510)  45.45 
 
 
775 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166413  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41487  predicted protein  43.23 
 
 
550 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00314101  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_3366  predicted protein  55.35 
 
 
225 aa  242  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.851714  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42768  predicted protein  40.38 
 
 
599 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.26 
 
 
738 aa  197  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.06 
 
 
760 aa  197  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  33.65 
 
 
739 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.53 
 
 
757 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.69 
 
 
740 aa  195  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  33.48 
 
 
703 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.15 
 
 
754 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.12 
 
 
743 aa  193  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  32.3 
 
 
699 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.7 
 
 
740 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.32 
 
 
754 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  33.04 
 
 
754 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.7 
 
 
742 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.51 
 
 
739 aa  190  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.93 
 
 
721 aa  189  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.1 
 
 
754 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 
776 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.72 
 
 
727 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.85 
 
 
759 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.75 
 
 
805 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.53 
 
 
742 aa  186  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  33.33 
 
 
764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.41 
 
 
718 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  33.89 
 
 
746 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.41 
 
 
755 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.42 
 
 
768 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.63 
 
 
730 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13383  predicted protein  56.89 
 
 
164 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.32 
 
 
719 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  31.06 
 
 
713 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 
810 aa  183  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.2 
 
 
732 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.41 
 
 
805 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.69 
 
 
769 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.35 
 
 
804 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  34.03 
 
 
763 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  32.92 
 
 
722 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.58 
 
 
810 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.1 
 
 
731 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.73 
 
 
754 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.4 
 
 
808 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.51 
 
 
731 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.21 
 
 
757 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.54 
 
 
757 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.17 
 
 
701 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.41 
 
 
731 aa  177  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.83 
 
 
718 aa  177  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
826 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.37 
 
 
704 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.56 
 
 
801 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.15 
 
 
738 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.04 
 
 
763 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.46 
 
 
773 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.18 
 
 
731 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.73 
 
 
756 aa  174  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.65 
 
 
723 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.35 
 
 
709 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  33.66 
 
 
732 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  30.95 
 
 
775 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.22 
 
 
753 aa  170  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.95 
 
 
801 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  31.49 
 
 
647 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.47 
 
 
738 aa  167  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  29.14 
 
 
829 aa  166  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.95 
 
 
772 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.36 
 
 
715 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  32.98 
 
 
703 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.91 
 
 
737 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.14 
 
 
736 aa  163  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.13 
 
 
736 aa  163  7e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.79 
 
 
735 aa  163  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  29.44 
 
 
721 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.01 
 
 
806 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.4 
 
 
784 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.68 
 
 
781 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  28.57 
 
 
804 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.4 
 
 
781 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.29 
 
 
737 aa  160  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  29.52 
 
 
613 aa  160  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.9 
 
 
800 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  35.19 
 
 
741 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.98 
 
 
810 aa  156  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  35.19 
 
 
741 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  35.19 
 
 
741 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  35.21 
 
 
729 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  38.06 
 
 
513 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  30.41 
 
 
814 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  29.93 
 
 
601 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  37.07 
 
 
728 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.51 
 
 
852 aa  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  37.07 
 
 
742 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  35.96 
 
 
733 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>