More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2200 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 695 aa  1417    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.64 
 
 		 462 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.43 
 
 		 1056 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 605 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.96 
 
 		 1022 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 361 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 		 988 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.49 
 
 		 706 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 		 1056 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 391 aa  128  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 1421 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.99 
 
 		 818 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 446 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  29.39 
 
 		 706 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 617 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 		 542 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.6 
 
 		 357 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 		 927 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.69 
 
 		 784 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.1 
 
 		 1694 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 331 aa  107  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.73 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 471 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 804 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 406 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 406 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 687 aa  103  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 306 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.05 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.85 
 
 		 334 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.24 
 
 		 810 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 422 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 649 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 404 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 878 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.55 
 
 		 746 aa  99  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 356 aa  97.4  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 515 aa  97.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 4079 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 342 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  25.97 
 
 		 442 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.42 
 
 		 1979 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 547 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.18 
 
 		 738 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 376 aa  94.4  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 465 aa  94  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 562 aa  93.2  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 425 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 280 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 284 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 750 aa  92.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.47 
 
 		 778 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.41 
 
 		 286 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 286 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.95 
 
 		 725 aa  90.9  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  30.27 
 
 		 306 aa  90.5  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 306 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 308 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.63 
 
 		 839 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.41 
 
 		 286 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 425 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 392 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.91 
 
 		 308 aa  87.4  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.06 
 
 		 539 aa  87  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.3 
 
 		 1007 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.09 
 
 		 745 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1138 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 260 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 280 aa  83.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 		 564 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 		 261 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.4 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.86 
 
 		 1056 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 632 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.95 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 4489 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  29.58 
 
 		 1240 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 239 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 291 aa  79.7  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 594 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 301 aa  79.7  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.02 
 
 		 820 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1192 aa  78.2  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.12 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 292 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 3035 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>