More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1793 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  54.3 
 
 		 654 aa  714    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 668 aa  1387    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.62 
 
 		 662 aa  636    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  54.14 
 
 		 684 aa  732    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  50.88 
 
 		 672 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  50.82 
 
 		 678 aa  656    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.09 
 
 		 647 aa  590  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  47.22 
 
 		 684 aa  581  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  46.03 
 
 		 682 aa  581  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  44.48 
 
 		 751 aa  537  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  43.35 
 
 		 701 aa  522  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  43.93 
 
 		 710 aa  504  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  38.88 
 
 		 679 aa  445  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.45 
 
 		 639 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  29.83 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.64 
 
 		 731 aa  212  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  30.03 
 
 		 742 aa  210  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  29.66 
 
 		 748 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.4 
 
 		 731 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.44 
 
 		 633 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.56 
 
 		 636 aa  200  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30 
 
 		 739 aa  198  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  29.48 
 
 		 768 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.63 
 
 		 770 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  29.48 
 
 		 768 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.72 
 
 		 646 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.62 
 
 		 668 aa  194  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.3 
 
 		 768 aa  193  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  27.68 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  28.96 
 
 		 716 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  28.53 
 
 		 736 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  28.62 
 
 		 716 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  28.86 
 
 		 716 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  29.82 
 
 		 716 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.2 
 
 		 741 aa  189  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.48 
 
 		 732 aa  188  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  27.15 
 
 		 759 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.28 
 
 		 728 aa  187  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.71 
 
 		 754 aa  187  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.91 
 
 		 748 aa  187  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  27.44 
 
 		 729 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.36 
 
 		 621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  27.65 
 
 		 740 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  29.79 
 
 		 729 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  28.15 
 
 		 725 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.2 
 
 		 646 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.37 
 
 		 784 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  27.91 
 
 		 712 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.37 
 
 		 784 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.83 
 
 		 742 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.63 
 
 		 785 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  28.55 
 
 		 716 aa  184  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  33.15 
 
 		 638 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  29.09 
 
 		 634 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  27.45 
 
 		 785 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.89 
 
 		 746 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  27.37 
 
 		 782 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  27.59 
 
 		 643 aa  183  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  28.04 
 
 		 722 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  27.71 
 
 		 1224 aa  183  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.51 
 
 		 728 aa  182  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  31.03 
 
 		 642 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.25 
 
 		 747 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  27.95 
 
 		 756 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 		 712 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.52 
 
 		 1217 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  27.47 
 
 		 749 aa  181  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.31 
 
 		 726 aa  181  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  27.32 
 
 		 674 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  27.42 
 
 		 737 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  27.86 
 
 		 652 aa  180  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.06 
 
 		 729 aa  180  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  29.06 
 
 		 741 aa  180  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  27.16 
 
 		 640 aa  180  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  27.7 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.8 
 
 		 743 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.35 
 
 		 822 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  28.41 
 
 		 716 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  27.22 
 
 		 782 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.99 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  28.5 
 
 		 746 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.37 
 
 		 635 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  29.4 
 
 		 737 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  27.1 
 
 		 727 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  26.61 
 
 		 755 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.6 
 
 		 732 aa  178  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  26.61 
 
 		 755 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  27.7 
 
 		 736 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  27.7 
 
 		 736 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  26.14 
 
 		 659 aa  178  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.43 
 
 		 659 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  27.27 
 
 		 728 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  27.38 
 
 		 621 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.71 
 
 		 736 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  27.73 
 
 		 812 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  26.69 
 
 		 749 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  26.77 
 
 		 765 aa  177  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  27.3 
 
 		 648 aa  177  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  33.52 
 
 		 771 aa  177  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  28.31 
 
 		 738 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>