More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0990 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.3 
 
 		 668 aa  714    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  100 
 
 		 654 aa  1366    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  56.45 
 
 		 684 aa  769    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52.28 
 
 		 678 aa  667    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  48.48 
 
 		 672 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.69 
 
 		 662 aa  642    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.55 
 
 		 647 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  47.23 
 
 		 684 aa  600  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  47.09 
 
 		 682 aa  593  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  47.88 
 
 		 751 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  44.95 
 
 		 701 aa  552  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  43.54 
 
 		 710 aa  527  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  39.36 
 
 		 679 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.34 
 
 		 731 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  29.92 
 
 		 1224 aa  208  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  29.59 
 
 		 716 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  28.99 
 
 		 740 aa  207  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  28.95 
 
 		 1240 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.05 
 
 		 646 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.92 
 
 		 721 aa  204  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.24 
 
 		 776 aa  203  9e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  29.21 
 
 		 648 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  28.42 
 
 		 729 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.77 
 
 		 639 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.57 
 
 		 668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.63 
 
 		 785 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  29.5 
 
 		 722 aa  200  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  29.19 
 
 		 716 aa  200  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  29.95 
 
 		 748 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  28.78 
 
 		 716 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.29 
 
 		 1320 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  27.78 
 
 		 765 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  27.69 
 
 		 659 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  27.69 
 
 		 659 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.05 
 
 		 784 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.6 
 
 		 636 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.78 
 
 		 784 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  28.07 
 
 		 740 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  29.39 
 
 		 742 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.28 
 
 		 770 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.71 
 
 		 731 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.27 
 
 		 748 aa  194  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.93 
 
 		 732 aa  194  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  27.35 
 
 		 749 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.62 
 
 		 839 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  28.87 
 
 		 834 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.35 
 
 		 621 aa  193  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  28.01 
 
 		 716 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.17 
 
 		 732 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.23 
 
 		 735 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  29.27 
 
 		 759 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  26.87 
 
 		 740 aa  192  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 		 768 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 		 768 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  27.86 
 
 		 766 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  28.82 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  27.9 
 
 		 765 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  27.16 
 
 		 723 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  27.34 
 
 		 750 aa  190  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.76 
 
 		 626 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  28.27 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.27 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  28.27 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.01 
 
 		 768 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03237  hypothetical protein  28.27 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0399493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  29.02 
 
 		 746 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  28.27 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  28.96 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  26.94 
 
 		 712 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  28.11 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  28.27 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.7 
 
 		 732 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  27.44 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  27.44 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  26.97 
 
 		 749 aa  189  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  27.24 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  29.36 
 
 		 716 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  27.47 
 
 		 756 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  28.11 
 
 		 728 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  28.11 
 
 		 728 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  26.78 
 
 		 712 aa  187  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  28.55 
 
 		 716 aa  187  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.64 
 
 		 646 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  28.62 
 
 		 737 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.76 
 
 		 670 aa  186  9e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  27.6 
 
 		 743 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  27.84 
 
 		 735 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  27.6 
 
 		 743 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  27.6 
 
 		 743 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  28.44 
 
 		 754 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  28.03 
 
 		 643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  28.43 
 
 		 728 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  28.42 
 
 		 729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  28.43 
 
 		 728 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0853  glycogen branching enzyme  26.18 
 
 		 622 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00164465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.3 
 
 		 741 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  28.19 
 
 		 764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  27.6 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.19 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.51 
 
 		 743 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>