More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88710 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  56.14 
 
 		 684 aa  811    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  59.1 
 
 		 682 aa  822    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  100 
 
 		 701 aa  1458    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  47.59 
 
 		 672 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  47.94 
 
 		 710 aa  660    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  47.13 
 
 		 751 aa  633  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  43.77 
 
 		 684 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  44.78 
 
 		 678 aa  580  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.59 
 
 		 647 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  44.95 
 
 		 654 aa  552  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.35 
 
 		 668 aa  522  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.29 
 
 		 662 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  33.97 
 
 		 679 aa  356  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  27.31 
 
 		 645 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  27.31 
 
 		 645 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  27.2 
 
 		 637 aa  200  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  28.64 
 
 		 645 aa  200  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  27.16 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  27.01 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  27.01 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  27.01 
 
 		 645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  27.16 
 
 		 645 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  27.07 
 
 		 645 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  27.23 
 
 		 645 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  27.52 
 
 		 648 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  26.43 
 
 		 680 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.27 
 
 		 735 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.27 
 
 		 732 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.51 
 
 		 639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  26.71 
 
 		 740 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.43 
 
 		 737 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  26.38 
 
 		 659 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  25.7 
 
 		 749 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  25.04 
 
 		 723 aa  177  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.41 
 
 		 668 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  25.86 
 
 		 834 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.11 
 
 		 626 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  25.85 
 
 		 659 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.51 
 
 		 728 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  25.96 
 
 		 1320 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.17 
 
 		 742 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.3 
 
 		 630 aa  173  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  26.34 
 
 		 774 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  27.63 
 
 		 748 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.06 
 
 		 841 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  27.09 
 
 		 749 aa  171  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.55 
 
 		 670 aa  171  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.82 
 
 		 638 aa  171  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  26.14 
 
 		 674 aa  170  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.76 
 
 		 654 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.33 
 
 		 659 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.17 
 
 		 633 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  24.85 
 
 		 729 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  26.36 
 
 		 763 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  26.19 
 
 		 722 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.77 
 
 		 732 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.32 
 
 		 631 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.02 
 
 		 674 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.85 
 
 		 822 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.8 
 
 		 1217 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  24.74 
 
 		 764 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.73 
 
 		 731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.92 
 
 		 741 aa  165  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.08 
 
 		 736 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  25.34 
 
 		 746 aa  165  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  26.84 
 
 		 754 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  26.28 
 
 		 725 aa  165  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.73 
 
 		 636 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.27 
 
 		 770 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.31 
 
 		 784 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.47 
 
 		 784 aa  164  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 		 764 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  25.43 
 
 		 725 aa  163  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  25.07 
 
 		 764 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  24.56 
 
 		 765 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  26.74 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  26.02 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  24.76 
 
 		 756 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  25.04 
 
 		 754 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  26.11 
 
 		 742 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.19 
 
 		 731 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.86 
 
 		 785 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  24.66 
 
 		 729 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  25.16 
 
 		 759 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  26.61 
 
 		 740 aa  161  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  25.4 
 
 		 729 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 		 728 aa  161  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  24.63 
 
 		 654 aa  160  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  25.62 
 
 		 745 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.66 
 
 		 721 aa  160  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  25.68 
 
 		 776 aa  160  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  25.31 
 
 		 727 aa  160  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  25.08 
 
 		 754 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  25.21 
 
 		 785 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  25.07 
 
 		 743 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  27.17 
 
 		 1224 aa  160  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.94 
 
 		 768 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  25.19 
 
 		 621 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  24.43 
 
 		 755 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  24.57 
 
 		 754 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>