More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0145 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.69 
 
 		 662 aa  652    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 647 aa  1332    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  50.24 
 
 		 684 aa  629  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  47.82 
 
 		 672 aa  631  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  49.92 
 
 		 678 aa  631  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  50.16 
 
 		 682 aa  611  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  49.68 
 
 		 684 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  48.55 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.09 
 
 		 668 aa  590  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  48.04 
 
 		 751 aa  588  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  48.59 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  46.6 
 
 		 710 aa  572  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  37.21 
 
 		 679 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.8 
 
 		 659 aa  219  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.08 
 
 		 639 aa  219  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  35.69 
 
 		 728 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  29.71 
 
 		 648 aa  211  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  29.49 
 
 		 782 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.29 
 
 		 737 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.19 
 
 		 742 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.18 
 
 		 770 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  29.18 
 
 		 738 aa  209  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.03 
 
 		 768 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.55 
 
 		 731 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  29.3 
 
 		 782 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  29.89 
 
 		 645 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  30.77 
 
 		 642 aa  204  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  29.89 
 
 		 645 aa  204  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.35 
 
 		 668 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.34 
 
 		 621 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  29.58 
 
 		 637 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.99 
 
 		 721 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  27.37 
 
 		 765 aa  200  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  34.66 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  35.88 
 
 		 729 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.72 
 
 		 747 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  29.24 
 
 		 645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  28.13 
 
 		 749 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  28.84 
 
 		 645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  28.08 
 
 		 716 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.8 
 
 		 784 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  34.56 
 
 		 722 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  27.38 
 
 		 754 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  28.3 
 
 		 634 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.8 
 
 		 784 aa  198  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  29.03 
 
 		 645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.96 
 
 		 736 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  29.03 
 
 		 645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.82 
 
 		 761 aa  197  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.62 
 
 		 630 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  28.9 
 
 		 645 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  28.9 
 
 		 645 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  27.09 
 
 		 749 aa  197  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  28.46 
 
 		 1224 aa  196  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  26.93 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  26.44 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.23 
 
 		 626 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.8 
 
 		 785 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  27.33 
 
 		 754 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  26.33 
 
 		 774 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  29.4 
 
 		 645 aa  195  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  29.7 
 
 		 716 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.99 
 
 		 1217 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  27.78 
 
 		 764 aa  194  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  27.23 
 
 		 763 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.4 
 
 		 743 aa  194  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.47 
 
 		 822 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.42 
 
 		 638 aa  193  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  29.08 
 
 		 766 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  26.72 
 
 		 750 aa  193  9e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  35.13 
 
 		 631 aa  193  9e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  32.71 
 
 		 643 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  33.71 
 
 		 737 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.35 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  28.03 
 
 		 677 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.81 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  26.73 
 
 		 725 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.8 
 
 		 760 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  27.2 
 
 		 755 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  33.24 
 
 		 732 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  27.2 
 
 		 755 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.2 
 
 		 743 aa  191  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  28.5 
 
 		 716 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  29.15 
 
 		 729 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  33.71 
 
 		 736 aa  190  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  32.49 
 
 		 740 aa  190  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  28.22 
 
 		 764 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  26.99 
 
 		 759 aa  190  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.81 
 
 		 746 aa  189  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  34.56 
 
 		 625 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  32.12 
 
 		 680 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  27.15 
 
 		 716 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  27.91 
 
 		 1240 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0257  glycogen branching enzyme  34.76 
 
 		 737 aa  188  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  28.37 
 
 		 716 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.74 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.37 
 
 		 670 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  27.64 
 
 		 785 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  28.79 
 
 		 674 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  27.88 
 
 		 740 aa  188  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>