More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0257 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0257  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 737 aa  1529    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.12 
 
 		 728 aa  682    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  46.75 
 
 		 748 aa  621  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  45.68 
 
 		 726 aa  618  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  46.28 
 
 		 746 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.48 
 
 		 735 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.48 
 
 		 732 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  49.77 
 
 		 725 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.54 
 
 		 631 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.76 
 
 		 736 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  44.53 
 
 		 740 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.65 
 
 		 731 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  46.63 
 
 		 728 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  44.72 
 
 		 785 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.6 
 
 		 726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  46.47 
 
 		 728 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  44.14 
 
 		 774 aa  601  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.96 
 
 		 721 aa  597  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  50.89 
 
 		 725 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  45.36 
 
 		 729 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  51.06 
 
 		 695 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  45.28 
 
 		 740 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  44.03 
 
 		 1240 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  45.26 
 
 		 749 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.4 
 
 		 732 aa  594  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  46.09 
 
 		 749 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 		 1224 aa  595  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  45.27 
 
 		 727 aa  595  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  43.8 
 
 		 735 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  44.6 
 
 		 712 aa  592  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.48 
 
 		 743 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  46.88 
 
 		 728 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.91 
 
 		 737 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.39 
 
 		 822 aa  588  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.17 
 
 		 1217 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  44.06 
 
 		 768 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.84 
 
 		 746 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  45.94 
 
 		 812 aa  587  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  45.35 
 
 		 722 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.93 
 
 		 743 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  44.06 
 
 		 768 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.2 
 
 		 747 aa  586  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  43.89 
 
 		 1320 aa  587  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.13 
 
 		 729 aa  588  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.96 
 
 		 734 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.02 
 
 		 761 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  47 
 
 		 677 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  44.19 
 
 		 723 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  44.71 
 
 		 740 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  43.78 
 
 		 732 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  44.32 
 
 		 732 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.33 
 
 		 736 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  44.94 
 
 		 716 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  45.05 
 
 		 738 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.15 
 
 		 839 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.84 
 
 		 741 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  41.7 
 
 		 736 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  41.84 
 
 		 736 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.6 
 
 		 957 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  45.48 
 
 		 755 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  45.24 
 
 		 716 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  42.53 
 
 		 741 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.33 
 
 		 754 aa  569  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  43.68 
 
 		 727 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.66 
 
 		 626 aa  572  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  43.88 
 
 		 728 aa  568  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  42.14 
 
 		 749 aa  571  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  49.75 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.9 
 
 		 741 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.55 
 
 		 630 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  41.86 
 
 		 743 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  43.3 
 
 		 782 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  43.73 
 
 		 763 aa  567  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  45.88 
 
 		 716 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.94 
 
 		 639 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  44.01 
 
 		 727 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  41.83 
 
 		 764 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.01 
 
 		 732 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.07 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  43.3 
 
 		 782 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  41.43 
 
 		 736 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  51.39 
 
 		 642 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.05 
 
 		 654 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  42.76 
 
 		 733 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  44.8 
 
 		 736 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.64 
 
 		 659 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  42.49 
 
 		 727 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  45.41 
 
 		 731 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  44.86 
 
 		 634 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 621 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  43.22 
 
 		 764 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  50.27 
 
 		 642 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.8 
 
 		 741 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  43.77 
 
 		 748 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  44.36 
 
 		 737 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.63 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  45.11 
 
 		 736 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  43.87 
 
 		 727 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  42.74 
 
 		 728 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  44.74 
 
 		 716 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>