116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1711 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  100 
 
 
753 aa  1570    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  45.86 
 
 
728 aa  629  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  44.63 
 
 
751 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  30.54 
 
 
747 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  30.13 
 
 
771 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  31.02 
 
 
782 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  28.87 
 
 
761 aa  300  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  28.83 
 
 
754 aa  296  7e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  29.6 
 
 
780 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  29.89 
 
 
774 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  29.51 
 
 
784 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.34 
 
 
781 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  31.15 
 
 
753 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.88 
 
 
771 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.19 
 
 
784 aa  280  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  29.19 
 
 
772 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.03 
 
 
807 aa  275  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  28.14 
 
 
785 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  28.84 
 
 
758 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  30.28 
 
 
755 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  29.54 
 
 
777 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  27.64 
 
 
757 aa  271  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  28.78 
 
 
790 aa  270  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  26.84 
 
 
759 aa  267  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  26.32 
 
 
778 aa  265  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  28.55 
 
 
790 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.8 
 
 
759 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.68 
 
 
827 aa  260  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  27.63 
 
 
747 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 
762 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  27.7 
 
 
773 aa  258  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  30.61 
 
 
1426 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  26.81 
 
 
976 aa  252  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  27.41 
 
 
751 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  27.14 
 
 
769 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  29.19 
 
 
740 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  29.61 
 
 
1189 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  27.67 
 
 
742 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  28.79 
 
 
775 aa  247  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  27.71 
 
 
795 aa  241  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.35 
 
 
769 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  26.47 
 
 
706 aa  233  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  27.33 
 
 
760 aa  231  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  28.17 
 
 
749 aa  230  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  26.04 
 
 
811 aa  229  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  26.44 
 
 
1075 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  26.52 
 
 
1089 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.02 
 
 
1322 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  27.62 
 
 
818 aa  227  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.15 
 
 
886 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  28.15 
 
 
886 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  28.15 
 
 
886 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.05 
 
 
888 aa  226  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  27.62 
 
 
818 aa  225  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  25.59 
 
 
943 aa  225  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  25.78 
 
 
760 aa  224  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.9 
 
 
771 aa  220  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  25.64 
 
 
826 aa  220  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.05 
 
 
1124 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  26.13 
 
 
797 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  24.96 
 
 
716 aa  217  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.84 
 
 
1114 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  25.72 
 
 
826 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  25.84 
 
 
745 aa  212  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  25.75 
 
 
1084 aa  210  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  29.7 
 
 
1465 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.87 
 
 
741 aa  207  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.83 
 
 
808 aa  207  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  26.7 
 
 
806 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 
1427 aa  204  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  27.49 
 
 
764 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  29.1 
 
 
877 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.79 
 
 
961 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  26.49 
 
 
901 aa  200  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  26.15 
 
 
986 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  25.78 
 
 
899 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.15 
 
 
955 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.15 
 
 
986 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.15 
 
 
986 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  26.15 
 
 
986 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.15 
 
 
986 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  28.22 
 
 
1053 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  25.84 
 
 
890 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  25.92 
 
 
1422 aa  195  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  29.79 
 
 
534 aa  193  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  26 
 
 
955 aa  193  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.19 
 
 
964 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  26.34 
 
 
901 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.82 
 
 
849 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  24.78 
 
 
757 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  26.94 
 
 
821 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  26.57 
 
 
917 aa  188  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  25.73 
 
 
819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  25.73 
 
 
819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  25.73 
 
 
819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  25.16 
 
 
823 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  29.19 
 
 
771 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.67 
 
 
846 aa  184  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  24.93 
 
 
768 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  26.91 
 
 
839 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>