62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1620 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  100 
 
 		 358 aa  742    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  35.03 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  30.42 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  30 
 
 		 451 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  26.2 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  28.17 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  21.76 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  24.52 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  26.89 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08930  periplasmic protease  30.99 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135221  normal  0.0516664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  26.4 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  22.94 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  24.5 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2481  peptidase S41  25.22 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  22.5 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  26.16 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  26.47 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  23.98 
 
 		 494 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 569 aa  49.7  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 		 434 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  25.69 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05520  C-terminal processing peptidase  24.14 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  23.64 
 
 		 525 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  23.33 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.52 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  24.41 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2480  peptidase S41  24.42 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0745  peptidase S41  22.87 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  26.81 
 
 		 438 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  25.7 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  28.99 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  24.06 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  24.88 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  21.82 
 
 		 552 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.9 
 
 		 1097 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  24.19 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  26.37 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  23.5 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  22.75 
 
 		 572 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  29.66 
 
 		 693 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  30.1 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  26.55 
 
 		 488 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  25 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  22.99 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.31 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0240  hypothetical protein  24.4 
 
 		 656 aa  43.5  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  unclonable  0.000497427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 401 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  25.9 
 
 		 551 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  25.42 
 
 		 423 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  30.43 
 
 		 683 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  22.83 
 
 		 710 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>