126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0240 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0240  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1293    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  unclonable  0.000497427  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0328  hypothetical protein  49.31 
 
 
682 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00617065  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0329  putative lipoprotein  34.87 
 
 
612 aa  264  3e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.300764  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf456  conserved hypothetical lipoprotein  25 
 
 
665 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320203  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf579  hypothetical lipoprotein, potential protease  25.98 
 
 
680 aa  111  5e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  25.39 
 
 
417 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  25.51 
 
 
496 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  25.51 
 
 
496 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 
444 aa  63.9  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  30.54 
 
 
472 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  29.34 
 
 
506 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 
491 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.02 
 
 
379 aa  58.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  26.45 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  29.02 
 
 
426 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  28.32 
 
 
433 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 
421 aa  54.3  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  26.82 
 
 
431 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  26.95 
 
 
434 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
429 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  29.01 
 
 
676 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2210  peptidase S41  29.12 
 
 
558 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185176  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 
410 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  30.17 
 
 
489 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  24.74 
 
 
423 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  28.1 
 
 
449 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 
472 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 
401 aa  52  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  29.59 
 
 
444 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  24.69 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04840  probable periplasmic tail-specific proteinase  29.84 
 
 
706 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  25.82 
 
 
445 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  27.09 
 
 
410 aa  51.6  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  29.11 
 
 
428 aa  51.2  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 
507 aa  51.2  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  25.66 
 
 
507 aa  50.8  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 
480 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  23.48 
 
 
698 aa  50.8  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  23.24 
 
 
423 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  24.44 
 
 
681 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  25.31 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  23.33 
 
 
547 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  30.65 
 
 
505 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  28.15 
 
 
402 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  27.41 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  25.73 
 
 
498 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  24.17 
 
 
427 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
397 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  25.15 
 
 
456 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  30.51 
 
 
649 aa  48.5  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  24.54 
 
 
440 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  28.4 
 
 
444 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  23.89 
 
 
690 aa  48.5  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  22.12 
 
 
401 aa  48.5  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1430  carboxyl-terminal protease  28.47 
 
 
727 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 
445 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.68 
 
 
427 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  28.4 
 
 
444 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  23.37 
 
 
446 aa  47.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 
494 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 
400 aa  47.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  22.9 
 
 
446 aa  47.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 
444 aa  47.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  25.65 
 
 
472 aa  47.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  24.44 
 
 
428 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  27.22 
 
 
440 aa  47.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  27.01 
 
 
425 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  24.9 
 
 
423 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
428 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  28.26 
 
 
443 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  24.55 
 
 
401 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  23.33 
 
 
690 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  29.22 
 
 
455 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  30.99 
 
 
680 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  24.07 
 
 
437 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 
444 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 
433 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  24.07 
 
 
437 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  28.4 
 
 
441 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 
469 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 
469 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  25.58 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 
469 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 
556 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
431 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 
401 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 
711 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  22.98 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  24.57 
 
 
443 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  24.28 
 
 
387 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  26.06 
 
 
401 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  24.84 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  23.3 
 
 
436 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 
478 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  25 
 
 
680 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>