193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0328 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0328  hypothetical protein  100 
 
 		 682 aa  1331    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00617065  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0240  hypothetical protein  49.31 
 
 		 656 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  unclonable  0.000497427  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0329  putative lipoprotein  34.02 
 
 		 612 aa  252  2e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.300764  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf456  conserved hypothetical lipoprotein  24.14 
 
 		 665 aa  99  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320203  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf579  hypothetical lipoprotein, potential protease  22.57 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  29.85 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  27.38 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 417 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.43 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  27.96 
 
 		 442 aa  60.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  26.86 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  21.78 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  27.22 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  25.6 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 496 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 496 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  26.79 
 
 		 402 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 484 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  27.84 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  30.46 
 
 		 410 aa  55.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  27.33 
 
 		 506 aa  55.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 		 494 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 		 498 aa  54.3  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  24.84 
 
 		 556 aa  54.3  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 444 aa  53.9  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  22.6 
 
 		 491 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  25.6 
 
 		 468 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  27.55 
 
 		 439 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  23.94 
 
 		 389 aa  53.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  24.31 
 
 		 532 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  24.67 
 
 		 672 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 		 547 aa  52.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  25 
 
 		 675 aa  52.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  24.06 
 
 		 438 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 383 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 470 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  23.96 
 
 		 387 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  24.42 
 
 		 673 aa  51.6  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 413 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 413 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  22.67 
 
 		 431 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  26.39 
 
 		 443 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  29.95 
 
 		 680 aa  51.2  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  27.67 
 
 		 433 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 		 446 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  25.48 
 
 		 681 aa  50.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  24.71 
 
 		 428 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  24.1 
 
 		 682 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  22.28 
 
 		 441 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 		 484 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 440 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  23.62 
 
 		 682 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 418 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  27.95 
 
 		 426 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  29.89 
 
 		 679 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2228  carboxy-terminal protease  25.13 
 
 		 683 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128038  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  25.16 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  24.1 
 
 		 682 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  24.1 
 
 		 698 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  23.16 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  24.1 
 
 		 682 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  25.14 
 
 		 440 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  25.42 
 
 		 418 aa  49.7  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  25.97 
 
 		 555 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  22.66 
 
 		 678 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  23.63 
 
 		 446 aa  48.9  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0702  hypothetical protein  23.46 
 
 		 434 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  24.22 
 
 		 434 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  24.03 
 
 		 689 aa  48.9  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 		 456 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  22.44 
 
 		 554 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  23.08 
 
 		 680 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  26.45 
 
 		 436 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  23.08 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  23.08 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  24.61 
 
 		 690 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  23.08 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  25.87 
 
 		 683 aa  48.5  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000352033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  23.08 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  22.49 
 
 		 444 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  23.08 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 458 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  23.08 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  23.08 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  26.11 
 
 		 693 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  23.17 
 
 		 437 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  23.11 
 
 		 564 aa  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1585  carboxy-terminal protease  24.48 
 
 		 681 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00663256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2202  carboxy-terminal protease  25.17 
 
 		 681 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.846279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  27.54 
 
 		 665 aa  48.5  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  25.15 
 
 		 421 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  23.74 
 
 		 673 aa  47.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>