More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0343 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 393 aa  814    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  74.81 
 
 		 401 aa  618  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  58.51 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  57.44 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  57.03 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  57.18 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  56.92 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  56.89 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  56.67 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  56.41 
 
 		 392 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  54.78 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  55.15 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  54.78 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  53.61 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  54.01 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  54.26 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  55.27 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  55.04 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  55.04 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  54.01 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  54.01 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  55.3 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  53.49 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  54.05 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  54.31 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  53.61 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  53.09 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  51.95 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  51.3 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  53.02 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  51.15 
 
 		 394 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  51.41 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  48.43 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  48.43 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  48.17 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  48.17 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  48.43 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  48.24 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  48.17 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  49.1 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  48.17 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  47.91 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  47.42 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  48.17 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  47.12 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  46.72 
 
 		 393 aa  362  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  48.22 
 
 		 398 aa  358  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  45.76 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  47.04 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  42.75 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.85 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.67 
 
 		 397 aa  345  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.6 
 
 		 396 aa  345  8.999999999999999e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.11 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.11 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.34 
 
 		 395 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.91 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.02 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  44.81 
 
 		 443 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 		 406 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  43.44 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.34 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  47.18 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.31 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.72 
 
 		 428 aa  335  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.73 
 
 		 391 aa  332  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.16 
 
 		 403 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.34 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1124  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.37 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000369055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.27 
 
 		 385 aa  329  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13730  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  43.5 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125718  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1317  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  45.2 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.87 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  46.53 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.57 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0692  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.79 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.09 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  44.76 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0610  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.22 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3858  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.92 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.82 
 
 		 403 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.05 
 
 		 402 aa  325  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 386 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  41.98 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3131  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.69 
 
 		 441 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2111  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.02 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0969779  normal  0.881002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 		 402 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1758  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.14 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831826  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  43.44 
 
 		 382 aa  322  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.01 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1719  cystathionine gamma-synthase  42.04 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.64 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6240  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  42.02 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  44.99 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.23 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>