197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  92.46 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  66.16 
 
 		 199 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  60.41 
 
 		 201 aa  254  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  59.69 
 
 		 199 aa  254  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  59.69 
 
 		 199 aa  254  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  59.9 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  59.39 
 
 		 201 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  56.57 
 
 		 200 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 		 199 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  54.41 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  57 
 
 		 201 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  47.21 
 
 		 202 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  52.26 
 
 		 198 aa  204  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  52.33 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  52.82 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  52.31 
 
 		 200 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  43.94 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 200 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  44 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 		 199 aa  168  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  42.78 
 
 		 205 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  42.78 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  42.27 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  45.34 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  29.19 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  30.43 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 		 256 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.26 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  30.28 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.67 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  23.81 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  25.56 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.32 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.67 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  30.07 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  25.6 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577833 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  23.04 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.26 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>