165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  85.65 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  35.45 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  38.81 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  38.36 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  37.17 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  35.68 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  37.9 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  36 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  36 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  36 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.51 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  34.8 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  32.59 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  35.09 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  32.71 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  36.05 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  32.43 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  28.44 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  33.01 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  29.38 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.8 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  36.84 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  29.02 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  30.52 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  36.54 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  24.43 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  24.43 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  30.11 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.36 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  24.09 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.32 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  33.65 
 
 		 509 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  29.91 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  35.37 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.25 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  31.29 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  29.23 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  20.45 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  37.62 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  21.52 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  26.51 
 
 		 521 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.97 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  23.45 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  34.57 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  33.02 
 
 		 395 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.38 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  23.28 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3031  O-methyltransferase family protein  31.96 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 285 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5884  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.46 
 
 		 422 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0711978  normal  0.210944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  33.14 
 
 		 414 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 344 aa  45.1  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 440 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 233 aa  45.1  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  22.79 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 355 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 355 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 355 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  28.32 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  33.58 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  31.43 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  29.25 
 
 		 343 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  44.23 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.3 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  30.23 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>