223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  96.34 
 
 		 383 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  33.96 
 
 		 432 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  35.43 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  35.05 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  33.43 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 396 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  37.92 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.59 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  33.68 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  36.18 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  35.99 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 384 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 384 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  32.73 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  30.97 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.29 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  35.18 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  30.05 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  30.05 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  30.05 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  30.05 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  34.65 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  29.79 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  36.44 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  31.4 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  31.4 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  28.21 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  31.4 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>