142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16141 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16141  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  253  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.21518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  48.33 
 
 
121 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1186  hypothetical protein  55.91 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.18 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  39 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  37.62 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  37.62 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  40.86 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  38.1 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  30.09 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  27.43 
 
 
114 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  34.26 
 
 
180 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  31.82 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  33.88 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  34.18 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  26.72 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  34.69 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  39.24 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  31.63 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  29.89 
 
 
119 aa  53.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.55 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  34.02 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  31.43 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  23.89 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  33.98 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  31.86 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  37.23 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  34.62 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  34.52 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36.26 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  37.21 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  37.21 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  30.97 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.77 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  34.41 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  26.6 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  34.18 
 
 
207 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  36.25 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  31.36 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  35.8 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  35.64 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  28.89 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  28.42 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.25 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  28.12 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  32.5 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  35.63 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 
125 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.44 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.36 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  35.63 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  35.8 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  26.47 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  29.9 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  30.09 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  31.03 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  28.7 
 
 
128 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  28.24 
 
 
112 aa  47  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  30.09 
 
 
124 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  29.07 
 
 
123 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  30.49 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  36.14 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  34.88 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  32.05 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1371  protein of unknown function UPF0102  44.23 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  36.14 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  30.39 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  29.63 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  36.14 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  32.56 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  35.8 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  28.3 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  31.36 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.21 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  32.91 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  35.23 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  38.1 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  26.09 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  36.14 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  31.97 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  38.16 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  36.71 
 
 
117 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.63 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  30.84 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  28.18 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  32.95 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  29.59 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  33.87 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  28.33 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  42 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  31.31 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  27.45 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  32.88 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  37.35 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>