More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04821 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
182 aa  358  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  79.12 
 
 
182 aa  298  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  78.57 
 
 
182 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  73.63 
 
 
182 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.19 
 
 
182 aa  229  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.19 
 
 
182 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
180 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.11 
 
 
180 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.44 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.14 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.14 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.14 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
182 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.99 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  37.2 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.07 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.47 
 
 
180 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.78 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.6 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.12 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
178 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  32.18 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  28.24 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  24.28 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.31 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.05 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  29.27 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.86 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  31.33 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  29.75 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  25.29 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  27.65 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  26.04 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.05 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  26.01 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.59 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  34.38 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  31.28 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.62 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
197 aa  72  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.99 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.99 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  25 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  30.17 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  34.05 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.06 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  29.89 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.83 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  27.37 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.06 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
275 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  26.22 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>