More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04391 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 
217 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 
217 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  56.36 
 
 
220 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  54.3 
 
 
218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  51.82 
 
 
219 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  54.75 
 
 
217 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  52.25 
 
 
222 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  53.85 
 
 
217 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  52.94 
 
 
217 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.05 
 
 
220 aa  167  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 
219 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
229 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
219 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  42.6 
 
 
222 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 
221 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  38.93 
 
 
241 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 
225 aa  157  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 
201 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.73 
 
 
217 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.08 
 
 
208 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 
200 aa  154  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 
200 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 
200 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 
217 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  38.77 
 
 
215 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  41.41 
 
 
200 aa  148  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  39.04 
 
 
227 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  41.06 
 
 
239 aa  147  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 
220 aa  147  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 
210 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 
220 aa  144  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  42.23 
 
 
209 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.78 
 
 
214 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
209 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 
217 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 
209 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
209 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  37.89 
 
 
219 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
209 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 
217 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 
217 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
209 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
209 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0271  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.800098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  39.23 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 
221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 
221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 
221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  39.71 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
216 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 
208 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  42.21 
 
 
220 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  37.89 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
226 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 
199 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  36.56 
 
 
218 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 
211 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  40.4 
 
 
211 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 
217 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  36.84 
 
 
221 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  37.93 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  33.48 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 
218 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 
218 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 
218 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  36.12 
 
 
217 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 
218 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
220 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  35.84 
 
 
218 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 
202 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 
199 aa  134  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>