More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1507 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.06 
 
 		 787 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.87 
 
 		 761 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1507  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 794 aa  1604    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.02 
 
 		 787 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  59.3 
 
 		 759 aa  817    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  56.28 
 
 		 713 aa  755    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  48.33 
 
 		 784 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  58.08 
 
 		 775 aa  837    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  53.29 
 
 		 760 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  57.12 
 
 		 756 aa  758    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  47.58 
 
 		 802 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  49.25 
 
 		 719 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  52 
 
 		 756 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  50.33 
 
 		 759 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  53.16 
 
 		 757 aa  716    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  58.4 
 
 		 740 aa  787    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  48.14 
 
 		 787 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.4 
 
 		 787 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  47.99 
 
 		 773 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  47.79 
 
 		 772 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  49.53 
 
 		 799 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.07 
 
 		 707 aa  670    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  51.99 
 
 		 754 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  59.84 
 
 		 754 aa  846    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  49.21 
 
 		 762 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  56.71 
 
 		 705 aa  776    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.62 
 
 		 757 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.76 
 
 		 788 aa  836    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.18 
 
 		 723 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.82 
 
 		 787 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  47.83 
 
 		 778 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  49.51 
 
 		 707 aa  665    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.73 
 
 		 723 aa  748    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  50.92 
 
 		 763 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  55.36 
 
 		 710 aa  760    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.12 
 
 		 779 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.89 
 
 		 779 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.32 
 
 		 779 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  46.09 
 
 		 779 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  49.39 
 
 		 801 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  49.16 
 
 		 772 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  47.07 
 
 		 778 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.86 
 
 		 804 aa  625  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  47.81 
 
 		 774 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  47.82 
 
 		 718 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  49.16 
 
 		 719 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  49.28 
 
 		 804 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  46.56 
 
 		 787 aa  626  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  49.16 
 
 		 719 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  46.76 
 
 		 773 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  47.01 
 
 		 777 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  47.01 
 
 		 788 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.49 
 
 		 803 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  47.38 
 
 		 799 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.34 
 
 		 781 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.02 
 
 		 813 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  47.46 
 
 		 773 aa  619  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  46.68 
 
 		 766 aa  622  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.7 
 
 		 774 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  48.2 
 
 		 782 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  46.76 
 
 		 772 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.52 
 
 		 780 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  46.61 
 
 		 795 aa  616  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  46.68 
 
 		 782 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  44.76 
 
 		 803 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  48.45 
 
 		 784 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  46.71 
 
 		 777 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  46.82 
 
 		 791 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  46.55 
 
 		 773 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.02 
 
 		 861 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.82 
 
 		 791 aa  615  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.02 
 
 		 774 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  46.82 
 
 		 791 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  47 
 
 		 814 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.81 
 
 		 773 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  46.94 
 
 		 773 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  46.81 
 
 		 772 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.14 
 
 		 784 aa  611  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.1 
 
 		 735 aa  611  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.02 
 
 		 774 aa  612  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  46.46 
 
 		 770 aa  612  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  47.9 
 
 		 838 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  46.68 
 
 		 773 aa  611  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  46.81 
 
 		 773 aa  611  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  47.55 
 
 		 798 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2912  Tex-like protein  47 
 
 		 797 aa  609  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.336311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.36 
 
 		 774 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  47.48 
 
 		 719 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  44.92 
 
 		 720 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  44.92 
 
 		 720 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  48.07 
 
 		 777 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  46.68 
 
 		 795 aa  612  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  46.94 
 
 		 773 aa  612  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  46.81 
 
 		 773 aa  611  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.6 
 
 		 786 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  46.81 
 
 		 773 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  45.86 
 
 		 793 aa  611  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  48.13 
 
 		 775 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  47.08 
 
 		 779 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.02 
 
 		 774 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>