96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0819 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.44 
 
 
868 aa  780    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.93 
 
 
859 aa  769    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
878 aa  1804    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.72 
 
 
868 aa  783    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  52.63 
 
 
881 aa  847    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  47.2 
 
 
869 aa  778    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.53 
 
 
866 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  42.22 
 
 
879 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.19 
 
 
864 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 
866 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  38.89 
 
 
892 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  38.34 
 
 
862 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  38.01 
 
 
896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  34.92 
 
 
860 aa  552  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  28.68 
 
 
567 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.42 
 
 
585 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.54 
 
 
588 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.73 
 
 
1016 aa  157  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.14 
 
 
998 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  26.28 
 
 
995 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  23.03 
 
 
825 aa  60.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.13 
 
 
902 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  25.29 
 
 
815 aa  59.7  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  26.52 
 
 
804 aa  58.9  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  22.32 
 
 
432 aa  58.9  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.2 
 
 
302 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  25.69 
 
 
869 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.53 
 
 
884 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 
793 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  27.48 
 
 
868 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  27.15 
 
 
853 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  24.56 
 
 
761 aa  53.9  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  23.99 
 
 
790 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  27.86 
 
 
893 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  26.52 
 
 
869 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  26.36 
 
 
868 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  23.26 
 
 
779 aa  52  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  25.56 
 
 
868 aa  51.6  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  32.52 
 
 
877 aa  51.2  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.28 
 
 
887 aa  50.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  28.16 
 
 
817 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  23.12 
 
 
795 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  25.64 
 
 
366 aa  50.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 
868 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.43 
 
 
835 aa  50.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  25.56 
 
 
868 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  25.56 
 
 
868 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  23.49 
 
 
758 aa  49.3  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  22.31 
 
 
798 aa  48.9  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  24.62 
 
 
870 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  26.32 
 
 
865 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  25.58 
 
 
868 aa  48.5  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.33 
 
 
869 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  27.27 
 
 
906 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  24.16 
 
 
758 aa  48.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  29.03 
 
 
890 aa  47.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  26.29 
 
 
796 aa  47.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  23.44 
 
 
870 aa  47.8  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  32.29 
 
 
803 aa  47.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  26.42 
 
 
804 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  22.09 
 
 
788 aa  47.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  25.77 
 
 
795 aa  47.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.16 
 
 
971 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  26.36 
 
 
866 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  21.36 
 
 
754 aa  46.6  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  27.34 
 
 
334 aa  47  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  24.9 
 
 
364 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  29.28 
 
 
810 aa  46.2  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  25.11 
 
 
812 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  29.73 
 
 
826 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  23.83 
 
 
788 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  34.29 
 
 
1097 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  31.58 
 
 
805 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  26.02 
 
 
814 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.06 
 
 
903 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  28.08 
 
 
825 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  23.38 
 
 
793 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.18 
 
 
840 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  22.16 
 
 
794 aa  45.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  30.61 
 
 
871 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.08 
 
 
821 aa  45.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.98 
 
 
887 aa  45.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 
805 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  28.4 
 
 
803 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.37 
 
 
971 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.01 
 
 
873 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  26.69 
 
 
801 aa  45.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  25.6 
 
 
780 aa  45.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  26.94 
 
 
923 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  23.14 
 
 
891 aa  44.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6481  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 
811 aa  44.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237379  normal  0.463412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  30.67 
 
 
414 aa  44.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  23.49 
 
 
758 aa  44.3  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
792 aa  44.3  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  24.64 
 
 
791 aa  44.3  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>