47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36244 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  51.24 
 
 		 673 aa  689    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  100 
 
 		 696 aa  1411    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  48.32 
 
 		 726 aa  632  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  46.19 
 
 		 690 aa  616  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  37.55 
 
 		 714 aa  462  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  20.17 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  21.23 
 
 		 1008 aa  68.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  23.79 
 
 		 1780 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  22.13 
 
 		 847 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  24.49 
 
 		 1484 aa  68.2  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  28.34 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  26.82 
 
 		 1869 aa  66.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42368  predicted protein  24.41 
 
 		 563 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0945405  normal  0.143131 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42299  predicted protein  20.77 
 
 		 873 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  20.41 
 
 		 851 aa  61.2  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  22.1 
 
 		 941 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  26.76 
 
 		 977 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15354  predicted protein  24.54 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267179  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  23.18 
 
 		 1031 aa  58.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48786  predicted protein  21.43 
 
 		 959 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  25.49 
 
 		 1699 aa  55.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 1424 aa  54.3  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 566 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 2262 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 2262 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 945 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  19.7 
 
 		 795 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 3145 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88041  TPR-repeat containing protein  31.03 
 
 		 629 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220076  normal  0.0637913 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04892  mRNA 3'-end-processing protein rna14 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3I8]  27.93 
 
 		 1075 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  20.12 
 
 		 808 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 968 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01635  mRNA splicing protein (Prp39), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09010)  21.74 
 
 		 588 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.26 
 
 		 2059 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  20.82 
 
 		 946 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70712  U3 snoRNP protein  24.24 
 
 		 434 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.555676 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25551  predicted protein  19.65 
 
 		 692 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0800445  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13053  predicted protein  24.37 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.34373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.5 
 
 		 935 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  18.29 
 
 		 827 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.13 
 
 		 883 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 647 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  22.55 
 
 		 395 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 465 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50268  predicted protein  29.63 
 
 		 385 aa  44.3  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.891923  normal  0.335478 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.65 
 
 		 725 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>