More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0938 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
242 aa  485  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
243 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
245 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  28.22 
 
 
238 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
238 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
237 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
237 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
245 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
234 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
238 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 
238 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  28.22 
 
 
237 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  26.45 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
240 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
241 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
237 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
237 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.03 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  23.55 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.23 
 
 
237 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.78 
 
 
238 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.82 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  26.92 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  25.41 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.26 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 
204 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  28.35 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  28.69 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.6 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  27.17 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  27.17 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150236 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  28.11 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  26.54 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.42 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  26.1 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.16 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  26.48 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  27.82 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  27.16 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.25 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.1 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  27.03 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.07 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07590  hypothetical protein similar to NADP-dependent mannitol dehydrogenase (Broad)  26.77 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.6 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  25.6 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.01 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  27.71 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  26.58 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.23 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362562 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.67 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
242 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.310245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  28.91 
 
 
245 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  27.6 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0067  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
296 aa  72  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  25.19 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  26.23 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>