More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4622 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  704    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  56 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  35.56 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33.6 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  31.18 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  36.86 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  36 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  36 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  36 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  36 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  36 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  36 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  35.43 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  36.1 
 
 		 314 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  32.48 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  32.91 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  32.91 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  32.59 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  32.59 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  32.59 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  32.59 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  32.59 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  30.69 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  27.27 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  27.27 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  23.51 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  32.17 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  36.09 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  32.05 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  32.09 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  32.09 
 
 		 320 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  29.05 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  35.58 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  33.47 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  34.3 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  34.3 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  33.71 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  33.71 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.4 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  33.71 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.83 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  31.72 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  23.89 
 
 		 304 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  31.72 
 
 		 308 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  32.17 
 
 		 321 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  30.74 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.08 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  32.84 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  33.22 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  29.53 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  30.25 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  30.38 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  34.59 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  34.59 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  24.91 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  32.26 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.65 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.58 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  30 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  27.97 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  29.73 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29.39 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 		 759 aa  80.1  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.58 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  25.38 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  30.47 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.62 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  30.47 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  27.56 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  30.82 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  32.97 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  30.82 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  33.56 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  28.33 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  29.31 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  30.07 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  33.77 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  28.86 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.96 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  29.69 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.97 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>