158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2511 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 229 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  51.25 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  43.58 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.31 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.31 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.69 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.95 
 
 		 253 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  43.55 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.06 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  37.5 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.75 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.29 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.76 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  37.07 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  37.07 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.51 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  38.3 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.96 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  41.62 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.23 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.16 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.51 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.02 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.1 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.5 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.91 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.47 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.57 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.57 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.52 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.08 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  32.13 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.51 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.3 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.3 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.3 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  32 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  36.95 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.65 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  31.53 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.68 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  31.91 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  31.91 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  31.91 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.25 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  31.91 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.49 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.93 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.16 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.93 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  33.5 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  23.24 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.06 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.06 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.06 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.63 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.19 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.33 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0787  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.26 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00056745  normal  0.0562894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.98 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  32.99 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.16 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  28.74 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  35.22 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.26 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.33 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.24 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.71 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.35 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.19 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.51 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  31.17 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  28.82 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  29.72 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 257 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.45 
 
 		 257 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 290 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.22 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  28.52 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.71 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.88 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.46 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.51 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  29.22 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  27.13 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.38 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  45.76 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  28.57 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  27.83 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.78 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.88 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>