More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2589 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2589  type II secretion system protein  100 
 
 		 394 aa  783    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  56.96 
 
 		 389 aa  401  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  56.25 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  50.64 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  50.89 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  46.95 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  45.57 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2793  type II secretion system protein  47.22 
 
 		 396 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  47.62 
 
 		 396 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  47.5 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  47.62 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  43.54 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3222  type II secretion system protein  44.42 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.333811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1432  type II secretion system protein  40.63 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02971  general secretion pathway GSPF-like transmembrane protein  44.8 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  36.75 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2309  putative GSPF-related transmembrane protein  39.35 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  33.59 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  36.66 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  37.18 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  31.82 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  33.07 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 405 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  37.4 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.44 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.84 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  30.66 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.15 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.35 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  29.44 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  30.52 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  27.81 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  30.18 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  28.65 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  31.11 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  27.56 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 404 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  30.63 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.53 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  28.61 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00345  putative general secretion pathway GSPF-related transmembrane protein  29.97 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.604529 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.53 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28.53 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  28.61 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  29.84 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2421  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.610249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  28.61 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  31.67 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  30.47 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.97 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  31.1 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  30.61 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  29.09 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  29.61 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  29.35 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  29.19 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  28.39 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 422 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  29.35 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  29.82 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 420 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  30.36 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  28.36 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  29.87 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  29.09 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  29.09 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  29.09 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  29.09 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  29.87 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  29.09 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  29.09 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  30.5 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.42 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  27.13 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  30.34 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  29.02 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>