169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0343 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  38.78 
 
 
251 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  46.73 
 
 
230 aa  154  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  41.78 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  39.58 
 
 
251 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  38.96 
 
 
253 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  38.3 
 
 
247 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  37.8 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  35.34 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  37.4 
 
 
253 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  44.94 
 
 
252 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  38.83 
 
 
253 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  34.71 
 
 
256 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  36.86 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  36.86 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  38.57 
 
 
253 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  37.68 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  39.63 
 
 
215 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  36.71 
 
 
253 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  38.07 
 
 
266 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  40 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  39.55 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  35.89 
 
 
259 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  40.31 
 
 
247 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  36.09 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.46 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  36.29 
 
 
262 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  34.39 
 
 
265 aa  99  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.96 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  32.16 
 
 
262 aa  85.1  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.41 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.98 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  31.4 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  33.48 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.03 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.85 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.83 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  30.33 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  33.85 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  33.6 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  33.6 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  32.89 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  32.49 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.05 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.06 
 
 
281 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  28.44 
 
 
219 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.99 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.44 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.99 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  31.09 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.4 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  30.91 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.42 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.23 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  30.43 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  26.53 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  30.17 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.42 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  30.32 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.33 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  31.98 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.52 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  25.93 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  27.52 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.8 
 
 
287 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  26.36 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.02 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  27.69 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.87 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  25.67 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.75 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  32.42 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  28.45 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  27.93 
 
 
262 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  29.32 
 
 
258 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  30.52 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  28.03 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  24.31 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  30.08 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.31 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  26.15 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  35.51 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  31.11 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  36.46 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.29 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  30.28 
 
 
461 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  32.2 
 
 
334 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  27.93 
 
 
224 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  27.93 
 
 
224 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.12 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  28.44 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  27.06 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  29.49 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  29.49 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  29.49 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>