More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0631 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 402 aa  810    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  34.62 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  34.93 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  32.73 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  33.51 
 
 		 390 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  34.13 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  33.87 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  30.98 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  34.31 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  31.81 
 
 		 407 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  27.65 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.55 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  27.32 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  29.95 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.51 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.39 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.34 
 
 		 431 aa  99.8  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.65 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  24.17 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  30.29 
 
 		 431 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 445 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  24.2 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.21 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.54 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  23.85 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.22 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.35 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  22.16 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.25 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  31.91 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.12 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  25.21 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  25.48 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>