More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3974 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
219 aa  438  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  59.22 
 
 
398 aa  200  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  49.67 
 
 
408 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.49 
 
 
437 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  30.96 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  27.81 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  32.58 
 
 
431 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.75 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.88 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.63 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
434 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.63 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
423 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  24.21 
 
 
408 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.88 
 
 
440 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.5 
 
 
410 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  33.94 
 
 
428 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  32.3 
 
 
432 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 
534 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.33 
 
 
439 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.61 
 
 
439 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.25 
 
 
440 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.25 
 
 
440 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
400 aa  61.6  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.72 
 
 
483 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.71 
 
 
439 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.71 
 
 
439 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.57 
 
 
429 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
390 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28.48 
 
 
437 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.11 
 
 
450 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
418 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
439 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  26.02 
 
 
428 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  25.62 
 
 
447 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
430 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
390 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.7 
 
 
430 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
439 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
434 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.62 
 
 
439 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25 
 
 
447 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  26.94 
 
 
408 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  25.62 
 
 
433 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  25.62 
 
 
428 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  25.62 
 
 
428 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.53 
 
 
434 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  25 
 
 
447 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
438 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
443 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  26.58 
 
 
430 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
484 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
390 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 
426 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  32.58 
 
 
472 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
435 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  25.97 
 
 
442 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
404 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  26.04 
 
 
408 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  28.57 
 
 
414 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
434 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
394 aa  55.1  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  26.71 
 
 
425 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
503 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  22.89 
 
 
424 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  24.2 
 
 
413 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
436 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.1 
 
 
503 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  30.41 
 
 
412 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
399 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
420 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
429 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  24.2 
 
 
428 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  26.71 
 
 
423 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
407 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
427 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.38 
 
 
417 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
425 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  28.12 
 
 
436 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  31.82 
 
 
472 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.95 
 
 
436 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  27.61 
 
 
423 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.33 
 
 
436 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.33 
 
 
436 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
431 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  23.89 
 
 
428 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  23.89 
 
 
428 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
384 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.33 
 
 
436 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  28 
 
 
425 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  31.67 
 
 
432 aa  52.8  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  27.33 
 
 
424 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  23.75 
 
 
441 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
516 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 
478 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
523 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 
545 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.63 
 
 
583 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>