56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1971 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1971  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 
216 aa  430  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3730  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  72.4 
 
 
204 aa  279  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.91 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0745  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.21 
 
 
221 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2789  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.65 
 
 
239 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.78 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.83 
 
 
239 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.56 
 
 
198 aa  99  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3736  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.66 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1185  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.14 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.59 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.6 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.38 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.19 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4963  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.69 
 
 
262 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.993638  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.77 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  28.79 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.33 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.56 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.56 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.09 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.94 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.21 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.69 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.3 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.67 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.36 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.04 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.11 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.49 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.54 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.41 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.7 
 
 
240 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  28.07 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.08 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.05 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1416  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.84 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.928147  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.23 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.83 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.45 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.64 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.48 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.36 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.85 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.25 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.71 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.34 
 
 
251 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.43 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.42 
 
 
247 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>