More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0223 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  87.71 
 
 		 179 aa  319  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  73.26 
 
 		 175 aa  262  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  71.1 
 
 		 174 aa  262  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  71.01 
 
 		 176 aa  251  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  55.49 
 
 		 169 aa  190  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  56.1 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  50.61 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  49.39 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  51.22 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  47.65 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  48.82 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  48.24 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  51.23 
 
 		 169 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  47.65 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  48.24 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  49.69 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  46.43 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  43.9 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  45.78 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  42.42 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  42.07 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  44.58 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  43.37 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  43.37 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  39.53 
 
 		 175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  38.18 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  38.86 
 
 		 175 aa  131  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  42.94 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  39.77 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.74 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  38.41 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  41.22 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  38.64 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  38.93 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  40.94 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  36.6 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  34.64 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  36.23 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  36.6 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0778  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.807556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  34.75 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  35.46 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3989  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0243679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  35.33 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  35.46 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  36.64 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  35.33 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  34.59 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03159  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000411475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0405  ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3603  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337541  normal  0.028029 
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3693  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000052658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  35.33 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  37.69 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  38.24 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  35.33 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3791  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000522149  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03110  hypothetical protein  37.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000280639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4631  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000345599  normal  0.589642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>